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第五周第2节

 王博士的御书房 2018-10-02
通过筛选后获得的报告结果要用生信技术来分析,具体不详。。。
生信技术分析分两步:原始数据转换成差异基因列表,整合分析。

一些牛逼的杂志在录用文章时要求作者上传高通量数据用以帮助没钱的人,因此从别人的高通量数据里面挖掘差异分子也是可行的。一般最好的是NCBI的GEO数据库,挖一个差异出来用。

肿瘤的数据库是最全面的,一个可用的数据库索引网站叫omictools

从数据库里面猜一批分子出来,主要是看那些差异很明显的分子,需要拿到差异分子列表,然后通过阅读文献和综述把有缺陷的分子排除掉,最后剩下两三个分子一起做实验,分子细胞动物实验去做,还可以做预实验来验证一下分子出现表型的可行性。分子做实验要一批一批做,一起做实验避免把宝压在一个分子上。

没得测序也没得数据库的穷鬼就从文献里面找,找三五本本领域的10分以上期刊把里面近三个月以来所有的有关分子的文章都找出来看完之后把有差异的分子列个表,然后一样的看文献读综述排除缺陷分子后留下两三个分子做实验。
 

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