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Nature一作在线解读:基于单细胞TCR的生物信息追踪方法揭示结直肠癌T细胞动态变化

 AndLib 2018-11-22

肿瘤免疫治疗方兴未艾,基于T淋巴细胞免疫检查点的发现和临床应用的成功推广,得到今年诺贝的青睐。虽然该疗法在多种实体瘤的部分患者中取得不错的疗效,但仍有一些肿瘤,特别是被认为缺少浸润免疫细胞的肿瘤患者的疗效并不尽如人意。近年研究报道基因组微卫星不稳定的结直肠癌患者对免疫检验点抑制剂PD-1抗体敏感,而我们对肿瘤浸润T淋巴细胞在结直肠癌中的分类和特征仍然缺乏了解,特别是对于微卫星不稳定与微卫星稳定患者间的T细胞类群及分子差异有待精细刻画。

2018年10月29日,北京大学张泽民课题组联合美国安进公司欧阳文军团队和北京大学人民医院申占龙课题组在国际顶级学术期刊Nature上在线发表了结直肠癌T细胞动态变化的重要研究成果。该研究对来自12例结直肠癌初治患者外周血、癌组织及癌旁组织的大量T细胞进行了单细胞全长转录组测序和分析。为了系统性的刻画结直肠癌相关T细胞的组织分布特性、克隆性、迁移性和状态转化,研究团队创造性开发了STARTRAC(Single T-cell Analysis by Rna-seq and Tcr TRACking)这一生物信息追踪方法,并揭示了结直肠癌中20类具有不同功能特性的T细胞亚类的动态变化关系。

经过近一个月的精心准备,“开讲啦,一作!”今晚将再次为大家奉上基因测序行业第一作者最新技术动态。本篇Nature文章第一作者北京大学生命科学学院张雷博士将于今晚8点与我们共同分享《基于单细胞TCR的生物信息追踪方法揭示结直肠癌T细胞动态变化》,为大家带来本篇力作的精彩解读。

开课时间:11月22日20:00

主讲人:

北京大学生命科学学院 张雷博士

讲者简介:张雷博士为北京大学生命科学学院张泽民教授实验室的博士后,博士毕业于北京大学分子医学研究所。在张泽民教授实验室,张雷博士采用单细胞转录组测序方法研究结直肠癌肿瘤浸润T细胞以及多种浸润免疫细胞的相互作用关系。近日,张泽民教授与合作者开发的基于单细胞TCR的生物信息学追踪方法,首次揭示了结直肠癌T细胞的动态变化。

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