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最近有小伙伴问小编怎样才能在进化树外层加圆环，以体现样品的分组（如下图所示），其实很简单，小编就来讲讲怎样实现吧。 使用的工具是iTOL这款在线软件，可点这里 绘一棵超酷炫的系统发育树 了解iTOL的使用方法。基础的使用方法就不再讲述了，只对配置文件进行说明。 注释文件准备首先来看一下所需要的注释文件的格式： DATASET_COLORSTRIP格式说明： 注释文件中以'#'开头的行是注释行，只起说明作用，iTOL不会读取该行的内容。 DATASET_COLORSTRIP：注释文件数据类型声明，这里声明数据集是为进化树外层添加彩色圆环。 SEPARATOR TAB：指定数据分隔符，即数据列与列之间使用Tab分隔。也可指定分隔符为空格，需将'TAB'改为'SPACE'。 DATASET_LABEL color_strip2：指定数据集标签，标签可任意。 STRIP_WIDTH 25：指定圆环的宽度。 MARGIN 0：指定圆环与进化树之间的距离，可为负数，会导致与进化树重叠。 BORDER_WIDTH 1：指定圆环边框的宽度。 BORDER_COLOR #000：指定圆环边框的颜色。 如果没有特殊设置，以上部分通常不需要改，直接拷贝使用即可。 DATA 之后的行就是所有的分组数据信息。数据分为两列，第一列为进化树叶节点ID，第二列是叶节点关联的颜色，每种颜色代表一个分组，不同分组的样品对应相应的颜色。可以用十六进制（#开头的颜色值），RGB表示法指定颜色。 注释文件美化按照以上格式准备好注释文件，准备好文件后直接将其拖到iTOL进化树展示所在的位置，就能自动给进化树外层加上圆环了。之后也可以在Datasets中对圆环位置、宽度以及圆环边框的粗细、颜色等进行微调。 以上操作介绍完了，怎么样？是不是很简单？有兴趣的小伙伴自己动手试试吧！ 最后祝您科研愉快！ |
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