Q1-qPCR 问:如何提高RT-PCR 反应的灵敏度与特异性? 答:
Q2-GCBI 问:请问什么时候能出个GCBI的使用教程啊,真心没什么时间自己研究啊 答:GCBI的教程可不是一个,而是好多好多个。小编已经整理成目录,下面是打开方式:
Q3-生信分析 问:通过正常组与疾病组RNA测序后进行差异表达分析,筛出来后进行GO注释得到的转录因子是否可以认为是关键转录因子? 答:不可以。转录因子的作用一般不是通过基因表达量的差异体现的,而是与入核机制,和启动子结合等调控功能有关,所以在疾病中研究转录因子主要是chip-seq或者RNA pull down -MS。 如果没有已知的相关研究报道,也可以通过ATAC-seq和RNA-seq联合分析来筛选可能的转录因子,最后通过chip-seq来确认。 Q4-高通量测序 问:做完测序后续还需要做哪些实验? 答:测序分析完成后,客户根据结果挑选目标基因或目标位点进行验证,验证符合后可以进一步做扩大样本验证和功能实验。 Q5-生信分析 问:分析结果中实验组某一样本的表达值与同组差异较大,不在均线,质检合格,是测序还是样本处理有问题,或者其他问题? 答:如果样本是同一批次处理的,存在差别时,一般是因为样本准备的问题;其次在测序之前,可以通过抽提的RNA质量和文库质量来判定样本之间的差别。 Q6-生信分析 问:启动子promoter区怎么预测吗?有什么推荐的网站或软件吗? 答:模式生物的话,比如人, 一般就是指起始密码子上游1-3Kb 的区域,推荐工具:https:///Promoters.htm Q7-数据库 问:有gene symbol和蛋白名称对应的数据库吗,想做二者的转换 答:uniprot数据库。网址: https://www./ |
|