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Clin Cancer Res | 甲基化标志物鉴定妇科肿瘤超早期癌前病变

 生物_医药_科研 2019-01-09

这是琪先生的第36篇原创文章


遇见 - 张超洋 (陕西话版) 来自琪先生 03:27


正文共:1483 字     预计阅读时间: 4 分钟

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photo by Murat Osman

宫颈癌前病变

指有癌变倾向,但又不能诊断为原位癌的宫颈异常增殖性病变,具有发展成为恶性肿瘤的潜能,长期存在即有可能转变为宫颈癌。


高级别浆液性卵巢癌是所有妇科肿瘤中最致命的。罹患这种疾病的女性中,有超过60%的患者是在发展到晚期阶段腹腔扩散时才被发现并得以诊断。因此,临床方面迫切需要能在可以在病灶切除治疗的癌前超早期阶段,就能够便于鉴定预测肿瘤发生的生物学标志物。


美国约翰霍普金斯大学的病理学王天麗(Tian-Li Wang)教授及其团队在Clinical Cancer Research期刊发表最新研究,发现通过c17orf64IRX2TUBB6基因启动子区的甲基化特征,能够在癌前病变早期阶段就鉴定宫颈癌的发生。


研究团队的首要目标是鉴定高级别浆液性卵巢癌组织中具有高度特异性和敏感性的差异甲基化位点,以便这些位点可能用于检测早期或少量病灶卵巢癌的甲基化生物标志物。因为在这个阶段对卵巢癌进行干预治疗的效果最好。


在这项研究中,肿瘤组织的病理类型包括高级别浆液性卵巢癌、子宫内膜腺癌、子宫浆液性癌和未分类的妇科肿瘤;而正常对照组则是由妇科良性疾病手术中的输卵管黏膜、子宫内膜和子宫颈内膜组织而组成。


在研究方法上,研究中利用MethylationEPIC芯片进行全基因组甲基化分析,再通过实时甲基化特异性PCR (SMART-MSP) 方法验证差异甲基化区域的诊断效果表现。


在发现阶段,采用MethylationEPIC甲基化芯片对96例恶性肿瘤和健康的妇科组织标本进行全基因组甲基化检测。甲基化芯片数据的非监督聚类分析表明,高级别浆液性卵巢癌与其他恶性妇科肿瘤相比,甲基化水平发生了显著改变,与正常黏膜组织的甲基化水平相比有明显不同。


通过生物信息学的分析,筛选出健康组织和癌变组织之间甲基化差异较大的8个候选甲基化片段。通过实时甲基化特异性PCR (SMART-MSP)交叉验证其中90个肿瘤和正常组织的甲基化片段差异情况,验证其作为肿瘤特异性甲基化生物标志物的作用。



基于c17orf64IRX2TUBB6未加权平均数的ROC曲线分析结果表明,联合三个基因甲基化特征辨别高级别浆液性卵巢癌和对照组织的敏感性和特异性都高达100%,区分其他妇科肿瘤和正常黏膜的AUC也达到0.991。



最后,由于要验证高级别浆液性卵巢肿瘤样本中观察到的高度甲基化事件,是否可能也存在于浆液性输卵管上皮癌病变中的设想。研究人员还对8例浆液性输卵管上皮癌变的上皮细胞的基因甲基化与12例正常对照的上皮细胞作了比较,结果显示在12例未患癌症女性的输卵管上皮样本中,7个基因都未表现出高甲基化状态。



上述试验研究数据表明,这些基因的甲基化水平改变有望被用于卵巢癌的超早期诊断,甚至还可能在病灶发展到卵巢之前的7年窗口期内提前检测到肿瘤病变。



参考文献

Methylomic Analysis of Ovarian Cancers Identifies Tumor-Specific Alterations Readily Detectable in Early Precursor Lesions. Clin Cancer Res. 2018 Dec 15;24(24):6536-6547.


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