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还没使用过的小伙伴，赶紧点开大显身手一番~使用指南详情请戳此链接：联川生物云平台使用指南； 联川云平台包含FAQ/SOP和云平台双重功能：丰富的FAQ/SOP，助你快速上手入门，更有详尽的分析技能小技巧等你来学习；云平台中包含科研中经常用到的分析绘图软件，可对实验数据进行统计分析、绘图等。 今天小编将与大家一起分享一篇云平台里的绘图小技巧，一起学起来吧~ 曼哈顿图本质上是一个散点图，用于显示大量非零大范围波动数值，最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究展示高度相关位点。它得名源于样式与曼哈顿天际线相似。近几年，在宏基因组研究领域，尤其是差异OTU结合分类学结果，采用Manhattan plot展示有非常好的效果，倍受推崇。大数据中，曼哈顿图优点在于既能展示数据全貌，又能快速找到目标基因或OTU，同时可知目标的具体位置和分类、显著程度等信息。绝对高端大气，而且还有内涵。 HaploView功能： 1.连锁不平衡LD与单倍型分析； 2.单倍型人群频率估算； 3.SNP与单倍型关联检验； 4.关联显著性排列检验； 5.从HapMap上下载基因型信息； 6.PLINK全基因组关联结果可视化。 Haploview的详细用法很多，这里只关注如何画manhattan plot吧，首先双击运行haploview.jar：（软件下载请大家自行解决哦：https://www./haploview/downloads） 1.打开如下的主界面（如果主界面默认是空白，就用file里面的open new data）： 2.填写file文件： 3.选择PLINK format选项，导入file数据，勾选Non-SNP： 4.参考选项填写相应的内容： 5.右击选择属性修改图标属性： 6.最后保存该图片即可。 |
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