TP53基因又称为P53,位于染色体17p13.1,是一个抑癌基因。TP53基因编码9种蛋白变异体(isoform),优势变异体的转录本号为NM_000546,有11个外显子,编码393个氨基酸。TP53蛋白可分为多个功能区域,每个都有特殊的功能(/): 1)N末端(氨基酸1-100)包含两个独立的转录激活域(TAD,氨基酸 1-42和43-62)和mdm2蛋白结合位点(氨基酸13-29)。氨基末端也包含高度保守区域I(CHD I),另外,一个核输出信号(NES)和脯氨酸富集区域(PRD,氨基酸64-92)也位于氨基末端。 2)中心区域(氨基酸101-300)包含DNA结合域(DBD),人类癌症中发现的85%的TP53突变都发生在这个区域。 3)C末端(氨基酸301-393)包含四聚化功能域(TET,氨基酸307-355)、核定位信号(NLS)、核输出信号(NES)以及调节功能域。 TP53的突变位点谱相当广泛,超过1800多种不同的突变被报道过,其中有六个热点残基(R175、G245、R248、R249、R273和R282)突变频率最高[1]。TP53突变主要分为功能缺失和功能获得两种类型,功能缺失型是指突变使TP53整个肿瘤抑制功能全部缺失,突变蛋白与野生蛋白组成异源二聚体,从而阻滞野生TP53功能,功能获得型指突变赋予TP53蛋白新的构象改变,允许它与下游效应蛋白进行不同的相互作用或结合全新的DNA靶序列从而获得新的功能[2, 3]。所谓TP53双突变主要包括三种类型:半合子突变(一个TP53等位基因丢失,另一个TP53等位基因突变)、复合杂合突变(两个不同突变分别位于不同的等位基因上)以及因同源重组造成UPD(单亲二倍体,两个TP53等位基因来自同一个亲本)的纯合突变[4]。 TP53是人类肿瘤中突变频率最高的基因,有超过50%的人类肿瘤携带TP53基因突变,目前发现TP53的体细胞及胚系突变有45000多个。与实体肿瘤相比,血液肿瘤中的TP53突变频率较低(5-15%),但突变涵盖所有的血液肿瘤类型,并且TP53的突变谱及突变频率因肿瘤类型及疾病状态不同而有所不同,TP53突变与异常核型(包括17p缺失)相关,且与不良预后明显关联[2]。 在慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia, CLL)中,TP53基因分析是疾病预后评估的重要部分,目前成为常规临床检测,主要针对TP53基因突变和TP53缺失(17p-)两个方面进行。二代测序检测TP53基因突变是目前有效的技术手段,其中靶向深度测序还可检测低丰度的突变(<1%),发现小的侵袭性克隆,从而有效监测肿瘤复发[5]。TP53突变在初诊CLL患者中相对少见(5-10%),但在复发难治患者中可高达40-50%,因此携带TP53异常的CLL患者在治疗干预中具备强大的挑战性[6]。CLL患者中大部分TP53突变也位于DNA结合域,且约75%的突变是错义突变,而截短突变更多发生在DNA结合域以外的地方,且与17p-的关联性更强[7]。类似的不均衡现象在李法美尼综合征(Li-Fraumeni syndrome,LFS)也存在,病人携带胚系截短突变,再肿瘤形成过程中因选择压力的缘故更倾向于TP53另一个等位基因丢失,而TP53发生错义突变的病例中,另一个等位基因丢失的情况很少,这可通过错义突变的负显性和功能获得性来解释[8]。 急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)中,TP53基因异常与复杂核型(complex karyotype,CK)高度相关,70%的CK-AML存在TP53基因异常(突变和缺失分别占60%和40%),且TP53基因突变与老年、基因组复杂性、特定DNA拷贝数变异、单体核型以及不良预后相关。至少2/3的TP53异常病例表现为TP53双突变。另外,与原发AML相比,TP53突变在继发(post-MPN或post-MDS)病例中更为常见[9]。 在骨髓增生异常综合征(Myelodysplastic syndrome,MDS)中TP53突变也与复杂核型密切相关,TP53突变在孤立型del(5q)MDS和伴-5/5q-复杂核型MDS中的突变率分别为19%和72%,在其他MDS中则为9%左右,TP53基因突变的患者使用阿扎胞苷治疗可获益[10]。MDS患者中的TP53变异形式通常为一个等位基因发生点突变,另一个等位基因由于17p-而丢失[11]。 慢性髓系白血病(Chronic myeloid leukemia,CML)中,TP53异常与疾病从慢性期向加速期转化,尤其是向急变期(blast crisis,BC)转化相关,在BC-CML中,TP53突变频率可高达25-35%[12]。除了TP53基因突变,17p-也常常发生。此外,超过50%的BC-CML病人中,TP53的功能可能是破坏掉的,原因是编码TP53调节子p14ARF的CDKN2A/B基因发生了纯合子丢失[13]。 在急性淋巴细胞白血病(Acute lymphoblastic leukemia,ALL)中,TP53突变与疾病复发、不良治疗反应以及短生存期相关。需要特别注意的是,儿童患者中,接近一半的TP53突变是胚系来源的,而ALL是李法美尼综合征的一种表现[14]。李法美尼综合征是一种复杂的遗传性肿瘤易感性疾病,与多种组织起源的早发癌症有关。75%的典型LFS患者中存在TP53胚系突变。TP53突变携带者终生罹患癌症可能性男性接近75%,女性接近100%[14]。 无论是在髓系还是淋系肿瘤中,TP53基因突变都严重影响患者的化疗反应,而且使用损伤DNA的药物可能对TP53突变的亚克隆有非常强的选择压力。低危MDS患者接受来那度胺治疗,在治疗期间TP53突变亚克隆扩增,并获得其他基因异常,一些病例最终转化为AML[15]。 在查看TP53基因突变结果时,需要考虑到TP53突变位点、突变形式以及突变频率等,除热点突变临床意义明确外,对于意义不明的突变位点需要查询相应的数据库[16]以便临床指导。 [1] Bisio A, Ciribilli Y, Fronza G, Inga A, Monti P. 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