还没使用过的小伙伴,赶紧点开大显身手一番~使用指南详情请戳此链接:联川生物云平台使用指南; 联川云平台包含FAQ/SOP和云平台双重功能:丰富的FAQ/SOP,助你快速上手入门,更有详尽的分析技能小技巧等你来学习;云平台中包含科研中经常用到的分析绘图软件,可对实验数据进行统计分析、绘图等。 今天小编将与大家一起分享云平台里的FigTree构建进化树(柱状)教程,一起学起来吧~ 系统进化树(phylogenetic tree)是表明被认为具有共同祖先的各物种相互间演化关系的树,又被称为系统发育树、种系发生树等。用来表示系统发生研究的结果,用于描述物种之间的进化关系。Fig Tree是常用的系统发育树做图软件,该软件因其做图美观且功能强大, 受到老师的青睐。 1.打开树文件.tre,初始状态如下; 2. 打开 Layout 布局标签,红框部分是不同的呈现格式,按要求选择;Zoom 标签是调整图的大小; Expansion 标签是调整图的高度;Fish eye 进行布局调整;Root length 是调节根的长度;Cuevature 是 调整角分支的线条; 3.Appearance 标签 Line weight 是调整分支的粗细; 4.Tip lables 标签,加上样本名;还可以改变样本名大小以及颜色; 5.Node labels 是添加节点标签;可以改变样本名大小以及颜色,sig digits 选项可以改变小数保留位数; 6.Node shapes 是改变节点形状以及大小; 7.Branch labels 是添加分支标签,可以改变字体颜色和大小, sig digits 选项可以改变小数保留位数; 8.Scale bar 是增加标尺; 9.Scale axis 是增加最下方的标尺;勾选掉 show grid 选项可以删除竖线部分; 10. Time scale 标签是调节最下方坐标轴的,scale by factor 是默认选项,scale root to 选项可改变轴的最大值。 11.Hilight 标签可以改变分支的颜色; |
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