电影《四大名捕》里面诸葛神侯的四大徒弟冷血、无情、追命和铁手各自身怀绝技的形象深入人心,但是他们又有共同的特点就是可以精准捕获要对付的目标。 现如今,精准医疗、精准测序的时代已经到来,“靶向”成了这一时代C位出道的明星。而基于探针杂交捕获方法的靶向测序,由于不易污染、捕获区域大的优势,是目前靶向测序的主流方法。 今天小编就为大家介绍其中的关键步骤——探针捕获!
1 在探针杂交之前,需先加入DNA封阻剂,竞争性结合文库基因中的重复性片段,减少对非目标序列的捕获,降低干扰,提高中靶效率。 Invitrogen Human Cot-1 DNA 是胎盘 DNA,长度主要为 50 至 300 bp,并且富含重复的 DNA 序列,可以用放射性的32P和生物素标记,能用于在微阵列筛选中阻断非特异性杂交。
添加Cot-1作为封阻剂之后,目标DNA区域的富集都能有显著提高! 这款优质的封阻试剂被多个探针捕获试剂盒生厂商推荐: 2 杂交捕获的原理是设计探针,与目标片段互补配对,将未被结合的片段洗脱,留下需要的目标片段。由于分离步骤通常使用的是能与生物素结合的链霉亲和素磁珠纯化,故而需要在核苷酸探针上添加生物素标记。 DNA探针: 推荐选择Biotin-14-dCTP和Biotin-14-dATP RNA探针: 推荐选择Biotin-16-UTP 3 接下来,就是久负盛名的Dynabeads Streptavidin磁珠出场啦! 作为生物素化配体和靶分子分离处理的金标准,Dynabeads Streptavidin磁珠表面有共价偶联的单层链霉亲和素,能结合生物素化的配体/靶标。
您知道吗?全世界有超过25000个日常 IVD 设备使用 Dynabeads磁珠,也被众多捕获试剂盒厂商推荐: 4 最后一步就是用磁力架将未被结合的片段去除,留下需要的目标片段。 如果您的样品是全血样本分离出来的总RNA,我们还为您准备了一个好帮手: GLOBINclear™ 试剂盒 全血样本分离出的总RNA里有大约70%是来源于球蛋白mRNA,如果不将球蛋白mRNA去除,会对低丰度转录本的分析造成严重的影响。 GLOBINclearTM 试剂盒使用磁珠法,探针捕获球蛋白mRNA,能够在90min去除95% alpha和beta球蛋白mRNA。
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来自: stingray928 > 《生物》