生信开发者往期精彩回顾

生信学习

    1.  新时代的生物信息开发者应该学些什么

    2. 临床生物信息培训班

    3. NGS在临床中的应用

    4. 漫话生物信息学的编程语言

    5. Bioinformatics On Windows

遗传病

1.  最好的流产物筛查方案

2.  实现一款NGS临床分析工具有多难（以WES CNV分析为例）

3. 可定制的在线CNV可视化工具

4. 遗传辅助诊断系统邀您注册

5. 可在线分析遗传病的遗传辅助诊断系统

6. 在线临床辅助诊断工具

7. 漏检的13号染色体 q端缺失真的不能无创检测吗？

8. 你们要的按表型自动化筛选位点功能已基本实现了

9. 表型分类树

10. 在CNV-seq、WES数据分析过程中，如何区分性别，以准确call性染色体上的CNV

11. WES 遗传病分析思路

12. 本地化的OMIM筛选临床表型相关的突变位点（以室间质评数据为例）
    

肿瘤

1.  分子标签（multiplexed PCR-based barcoding of DNA）在NGS中有哪些应用？

2. WES 适合做ctDNA测序么？

3. VEP后续处理工具

4. 肿瘤突变位点过滤和注释策略

5. 最新的肿瘤数据分析方案

6. Somatic Muation分析工具lancet

7. NCCL体细胞突变生信室间质评对答案啦

可视化工具

1.  使用R语言统计fasta文件中序列的长度分布

2. using c to QC fastq[.gz] file[s],including RC,GC,Lenfreq,Q20,Q30

3. 使用c语言 画随机矩阵热图

4. 使用R语言 生成hg19的染色体核形图（cytoband）

5. 使用python生成定制化的svg图

6. 开源NGS可视化方案

7. Ideogram.js——a JavaScript library for chromosome visualization

8. C语言bam可视化方案

9. VCF visualization interface

10. 染色体分布图该怎么做
    

11.  可定制的在线CNV可视化工具

生信工具

1.  实现一款NGS临床分析工具有多难（以WES CNV分析为例）

2. 可定制的在线CNV可视化工具

3. WES 数据如何计算捕获效率

4. vcf2vaf

5. 关于VAF分析

6. 介绍一个 可画各种有机体各种生理系统、器官的R包

7. 一些c语言写的处理bam和fastq(.gz)的小工具

8. VEP后续处理工具

9. 抗生素抗性基因筛选

10. 如何用GSA SNP array call CNV/UPD/非整倍体/多倍体

11. （基因分析黑科技）基于基数排序算法实现的samtools sort

12. R语言读取mp3格式心跳数据准确预测心率

13. 如何优雅地对fastq(.gz)文件按ID或sequence排序

14. 如何筛选出VEP注释中的canonical transcript注释

15. 获取基因组（hg19）上的gap区间（fasta文件中是N的序列的位置区间）

16. 替换字符串中所有指定子字符串replaceAll之C++实现

17. 用perl加载带中文的excel表格（xlsx）

18. vcf突变筛选之bcftools

19. fastq_pair过滤不成对的reads

20. tools for Structure Variation calling

21. 64位Windows下double click 压缩整个文件夹下的.fastq(.gz)文件

22. 关于vcf文件排序问题

23. 用一行命令限定fasta文件中每行序列的长度

24. 非root账号一键自动编译安装gcc

25. bam文件急速depth计算工具

26. R语言求任意多个向量的并集、交集...

27. 从vcf中筛选指定基因组区间（genomic region）列表的突变位点

28. 如何批量从多个基因组区间中得到位于其间的所有gene list

29. Somatic Muation分析工具lancet

30. Bioinformatics Tools On Windows

31. R语言 线性回归

32. perl中根据索引号交换数组的两个元素

33. C语言lowess拟合数据，用R语言展示

34. 用perl计算序列的反向、互补、反向互补序列，和序列的GC含量

35. 获取R脚本的程序名和所在目录

36. 使用c语言分割字符串

37. R调用c语言 生成R矩阵

38. 使用c语言 画随机矩阵热图

39. using perl to generate a random fastq file

40. 使用R语言统计fasta文件中序列的长度分布

生信杂谈

1.  Structural Variation（结构变异）检测方法

2. 分子标签（multiplexed PCR-based barcoding of DNA）在NGS中有哪些应用？

3. WES 适合做ctDNA测序么？

4. 关于对《WES如何计算捕获效率》的错误修正和引申讨论

5. 关于VAF分析

6. 好东西应该再次分享——CNV数据分析

7. 关于NGS序列比对软件的思考

8. bwa作者lh3有了新去向，赶紧投CV吧

9. 如何在非异构计算架构下提升NGS分析性能

10. 漏检的13号染色体 q端缺失真的不能无创检测吗？

11. 由DTC降价想到的

12. 我为何使用Makefile写流程

13. WES GATK best practice分析流程分块并行化实战

14. 你所不知道的seq技术

15. 关于生物网站的数据库架构的讨论

16. RNA-seq数据分析

17. 关于Illumina平台的adapter序列分析

18. 我们为何使用Makefile写流程

19. How can I improve the performance of R?

20. 关于NIPT的一些Q & A
    

服务

1.  我们提供NGS数据重分析和解读服务啦

2. 临床生物信息培训班（长沙站）

3. 即将推出NIPT 和CNVseq数据在线分析系统

4. 生信企业解决方案