分享

更多

   

利用3D Slicer对CT和MRI图像一键配准融合

2019-02-11  ssiver

作者王奎重 博士 济南军区总医院神经外科

审校:曹玉福 鹤岗市人民医院

声明文章所有权归属作者,如需转载或引用图文请联系作者并注明出处。文章仅代表作者本人观点,因应用本教程引起的法律纠纷与编审人员及3DSlicer公众号、网站、论坛无关。

3D Slicer有强大的配准融合功能,General Registration (BRAINS)模块虽然配准精度高,但设置参数较多,过程复杂,初学者难以掌握。本文介绍另外一个配准模块Elastix,可以对CT和MRI图像一键配准。


1、下载并打开3D Slicer4.8.1软件,安装扩展模块Elastix。关闭并重新打开3D Slicer,载入CT(6 1)和MRI(Ax 3D T1BRAVO)图像数据。在前景和背景窗口中可以看到CT和MRI图像未重叠。

2.打开Registration类别的General Registration(Elastix)模块,在Fixed volume栏里选择磁共振数据(Ax 3D T1BRAVO),Moving volume栏内选择CT数据(6 1),设置Output volume和Output transform名字,其余为默认选项。点击Apply进行配准。

3、稍等片刻,即可配准成功。在窗口前景中选择磁共振数据(Ax 3D T1BRAVO),背景中选择新输出的数据volume,调节滑动条透明度,即可显示CT和MRI图像配准效果。

4、新生成两个mha文件存在其默认文件夹中,时间长了容易变成垃圾文件,可以更改路径后进行保存。

5、图像配准和融合是两个不同的概念,配准是两张图像的空间位置改变使其重叠,但还是各自原来的图像。融合是两张图像融为一体不能分开,有关融合方法我以前有过介绍,这里不再赘述,实际应用中只需要配准功能就足够了。

图像融合的方法:打开Add Scalar Volumes模块,输入磁共振(Ax 3D T1BRAVO)和数据volume,设置新融合的数据名称,点击Apply即可融合在一起。 

本文介绍了利用3D Slicer对CT和MRI图像一键配准融合,可以快速实现同一患者不同模式图像的融合,操作过程中也可以调节不同参数及选择不同的预设(Preset)。笔者在实际应用中发现不同机器扫描图像通过3D Slicer打开时甚至不能同时显示在视野内,这可以通过粗略变换图像坐标实现;即便同一个病人扫描的MRI数据,由于扫描时间长不同序列间还是有细微的位置改变,而通过3D Slicer配准功能,可以消除这些肉眼所见到的位置改变。  

    本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。如发现有害或侵权内容,请点击这里 或 拨打24小时举报电话:4000070609 与我们联系。

    猜你喜欢

    0条评论

    发表

    类似文章 更多
    喜欢该文的人也喜欢 更多