中华门是南京明城墙的十三座明代京城城门之一，原名聚宝门，是中国现存规模最大的城门，也是世界上保存最完好、结构最复杂的堡垒瓮城，其建筑规模仅次于通济门（现已不存），有“天下第一瓮城”之称。中华门布局严整、构造独特，是研究中国古代军事设施的重要实物资料，不论是在军事上、历史上、还是在文化上、城建史上，都占有重要的地位。
中华门曾是南唐国都江宁府和南宋陪都建康府城的南门，明朝洪武二至八年（1369至1375年）其扩建而成，称聚宝门。1931年（民国二十年）国民政府改名为中华门。
集庆门是南京明城墙的后开城门，开辟于1991年，位于南京市秦淮区明城墙西南段、水西门以南、集庆门大街东端护城河东侧。集庆门座东朝西，是南京城墙在建国后开的第二个城门。
中山门，旧称朝阳门，为南京明城墙明代十三座内城门之一，中山门原为明代朝阳门瓮城，因城门位于南京城东，最先迎接太阳而得名。
1928年（民国十七年），国民政府为迎接从北平南下的孙中山灵柩，兴建中山大道时，将原朝阳门瓮城拆除，修造三孔拱形砖门，并在门洞上嵌“中山门“的题字石额，修建中山码头通向中山陵的大道。
标营门，为南京明城墙增辟城门之一，位于月牙湖公园旁，因位于南京后标营附近而得名。
1996年开通后标营路，修建月牙湖大桥，将该段南京明城墙开辟豁口，成为一段城墙断口。
2009年南京市政府为重新连接，沟通南京明城墙豁口，修建标营门
武定门，为南京明城墙民国增辟城门之一，介于中华门、雨花门与通济门之间，城门因位于城内长乐路中段的武定桥而得名。
武定门段城墙原为明城墙上的一处豁口，民国二十二年（1933年）被改造兴建为一处城门，并命名为武定门。与同时期开辟的汉中门、新民门均为西式牌楼式城门。
上世纪50年代，席卷全国的拆城运动波及南京，其中武定门城门遭到拆除，其城砖被用作建高炉或附近民居。
2010年，南京市人民政府重新连接武定门段城墙，复建武定门，为三拱券城门。
清凉门是是南京明城墙的十三座明代京城城门之一，因坐落在清凉山得名，现由一道城门和一圈椭圆形瓮构成，主城门为单孔拱券结构，城门楼上的城楼已经不存在，城顶上存留一块绞关石，上凿有两个绞孔，瓮城呈半圆形，正对城门，坐东朝西。
仪凤门，又称兴中门，是南京明城墙的13座明代内城门之一，位于南京城北下关卢龙山（狮子山）南麓与绣球山之间。1931年（民国二十年）国民政府改仪凤门为兴中门，取振兴中华之意。1971年，仪凤门城门在席卷全国的拆城运动中遭到拆除，两侧城墙尚存。2006年，仪凤门段城墙重新连接，城门以及其城楼建筑复建完成。
太平门，为南京明城墙十三座明代内城门之一，位于南京城东北垣，是明代京城的正北门，以南是朝阳门（今中山门），西北方向是神策门。因城门外为天牢所在，时常传出囚犯的哀呼之声，希望城内太平和谐，故取名“太平门”。
1911年（清宣统三年），徐绍桢率苏浙联军由太平门光复南京，城楼在战火中被炸毁。
2014年江苏省政府上报国家文物局经批复后，改建太平门。
挹江门，是南京明城墙民国增辟城门，位于今南京市鼓楼区西北段城墙，架两山之间。
1921年（民国十年）将城墙凿开，时为单孔城门。为中山码头和下关火车站入城的交通要道，因主持修造者为江苏省民政长韩国钧，系泰州人，泰州古称“海陵”，得名海陵门。
1928年（民国十七年）7月，国民政府将海陵门易名为挹江门，1929年，为准备奉安大典，改为三孔多跨连拱的复式券门，是南京城第一个三孔券门。同年4月，国民政府考试院院长戴季陶题写“挹江门”匾额。
玄武门是南京明城墙的后开城门，玄武门开辟于清光绪三十四年（1908年），为方便中外来宾游览玄武湖，决定该段城墙上开辟城门，命名为“丰润门”。
1928年4月，国民政府将丰润门易名玄武门；1929年时任中央研究院院长的蔡元培先生应邀题匾“玄武门”三字，沿用至今。1931年玄武门由单孔券门改辟为三孔券门。
神策门是南京明城墙十三座内城门之一，又称和平门，是南京明城墙保存最为完整的一座，也是所有城门中唯一保留有民国以前镝楼的城门。神策门是南京明城墙中唯一的外瓮城城门。
民国十七年（1928年），国民政府将其改名为“和平门”。
解放门是南京明城墙于1954年新开的城门，为单券城门，1952年6月1日竣工。玄武湖岸边这段从玄武门经解放门至太平门的明城墙，是南京城现存最长、最完好，同时也是最高大的一段城墙，垛口至城外地面的高度普遍在20米至25米左右。近年来经过整修，在该门上修建了南京城墙博物馆，使得解放门本身也成为了一个旅游景点。
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