根据近几年来的大量研究证实,肠道菌群能够影响人体生理和心理健康的方方面面。尽管如此,依然有很多细菌仍未被科学家们“定义”。近日,一项新研究发现了大约2000种过去未知的肠道细菌。 这项发表在《Nature》上的新研究发现了1952种新肠道细菌,这些细菌是科学家以前从未在实验室培养过的。 该研究团队由位于欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和Wellcome Sanger研究所的研究人员组成。他们使用计算分析评估了来自世界各地参与者的肠道微生物组样本。 研究通讯作者、EMBL-EMI的Rob Finn解释说:“计算方法使得我们能够发现尚未在实验室中培养的细菌。使用宏基因组分析遗传物质重建细菌基因组有点类似在把成百上千的拼图打乱混到一起后再对它们进行重新拼接,而且我们并不知道最终的完整图片是什么样的,甚至混在一起的拼图可能还会缺失,这使得该任务更加艰巨。” 然而,Finn继续说道:“现在研究人员可以利用一系列计算工具来补充甚至是指导实验工作,以取得关于人类肠道的新发现。” 一种新方法 研究团队从11850份不同肠道微生物组样本中重建了92143个基因组。这使得他们发现了在此之前不为人知的1952种新肠道细菌。 Finn解释说,很多细菌物种都“保持低调”,研究人员只在肠道内发现了数量非常少的细菌,或者它们无法在肠道以外的环境定植。 这使得研究人员无法将这类细菌列入他们已知的肠道细菌名单。因此研究团队决定采用一种新方法,与各种计算方法相结合,试图绘制出更全面的人类微生物组图谱。 研究第一作者Alexandre Almeida说:“计算方法使得我们能够了解很多定植于人体肠道中的细菌类型,包括它们是如何进化的,及其在微生物组环境中可能发挥的作用。” 打造“稳固的蓝图” Almeida解释说:“在这项研究中,我们利用了最全面的胃肠道细菌公共数据库来识别以前从未见过的细菌种类。我们使用的分析方法是高度可复制的,可以在未来被应用于更大型的、更多样化的数据集,从而取得进一步发现。” 在未来,研究人员希望,这种类似的研究将进一步帮助他们理解人体肠道,有助于开发出治疗各种疾病更好的疗法。 该研究的共同作者、Wellcome Sanger研究所的Trevor Lawley说:“像这样的研究正在帮助我们创建所谓的人类肠道蓝图,在未来,它可以帮助我们更好地了解人类健康和疾病,甚至可以指导胃肠道疾病的诊断和治疗。” 与此同时,该团队指出,这项研究让他们更加意识到在肠道细菌的研究方面还存在很大差距。他们强调,除了居住在欧洲和北美洲的细菌外,他们对其他地域人体肠道细菌种类了解得相对较少。 Finn说:“我们在欧洲和北美人口的数据库中发现了很多相同的细菌类型。然而,我们在这项研究中获得的少数南美和非洲的数据集显示,在以前的种群中不存在显著的多样性。” Finn补充说:“这表明,如果我们想对人体肠道的构成有一个真正全面的了解,那么从代表性不足的人群中收集数据是至关重要的。” 他呼吁研究人员继续关注更加多样化的人群。 中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上,发表和介绍国内外原创的科研成果。 注:国内为原创研究成果或评论、综述,国际为在线发表一个月内的最新成果或综述,字数500字以上,并请提供至少一张图片。投稿者,请将文章发送至weixin@im.ac.cn。 本公众号由中国科学院微生物研究所信息中心承办 |
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