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自然:生物性别影响癌症类型的肿瘤演变

 生物_医药_科研 2019-02-15

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 近日《自然》杂志发表的一篇文章,根据跨越近2000种肿瘤和28种癌症的基因组分析,一个人的性别可以影响他们发展的致癌突变种类。


结果显示,在生物学上男性和生物学女性中发现致癌突变的显着差异 - 不仅包括潜伏在肿瘤中的突变数量,还包括那里发现的突变种类。例如,来自女性的肝肿瘤更有可能携带由“错配修复(mismatch repair)”的DNA修复系统缺陷引起的突变;而患有任何癌症的男性更有可能表现出DNA的变化,这种变化或与自身用两条断裂的DNA链修复DNA的过程有关。

这些偏见可能使研究人员了解肿瘤如何在性别中发展和演变的关键生物学差异。(该研究没有考虑捐赠组织样本的人的性别,这可能与他们的生理性别不同。)这项工作上个月作为bioRxiv服务器1的预印本出版。



亚利桑那州立大学坦佩分校的遗传学家Kenneth Buetow说,这些数据增加了人们越来越多的认识,即性别在癌症中很重要,而不仅仅是因为生活方式的差异。例如,肺癌和肝癌在男性中比在女性中更常见 - 即使在研究人员控制吸烟或饮酒的差异之后。然而,这种偏见的根源尚不清楚。“这是癌症研究组合中一个显着未被充分研究的组成部分,”Buetow说。“有一个普遍的假设,直到最近才进行正式测试,不存在显着差异。”

映射突变

2014年,美国国立卫生研究院开始鼓励研究人员考虑临床前研究中的性别差异,例如,在研究中包括女性动物和女性细胞系。此后,一些研究发现某些癌症类型的蛋白质编码基因突变频率存在性别相关的偏倚,包括一些脑癌2和晚期黑色素瘤3。

但是,目前尚未经过同行评审的bioRxiv预印本是迄今为止对肿瘤基因组性别差异最全面的研究,Buetow说。它不仅在编码蛋白质的基因中发现突变,而且还在具有其他功能的广阔DNA中发现突变,例如控制何时打开或关闭基因。该研究还比较了许多不同癌症的男性和女性基因组,这可以让研究人员获得额外的DNA突变模式,部分原因是通过增加样本量。

加州大学洛杉矶分校的遗传学家保罗·布特罗斯及其同事分析了国际癌症基因组联盟收集的全基因组序列。他们研究了已知可导致癌症的174种突变频率的差异,并发现其中一些突变在男性中发生的频率高于女性,反之亦然。当他们更广泛地看待基因组中DNA片段的丢失或重复时,他们发现有4,285个性别偏见基因分布在15条染色体上。



当肿瘤发展过程中出现一些突变时,也存在差异,这表明某些癌症在男性和女性中遵循不同的进化途径。

布特罗斯和他的同事们也研究了DNA变化的特定模式。在某些情况下,这些模式可以反映突变的来源。例如,烟草烟雾在DNA中留下了特定的特征。

总而言之,该团队发现了一种性别更频繁发生的八种突变模式。例如在所有癌症中,97%的来自女性的样本具有特征性DNA特征,其特征在于错配修复中的缺陷。但只有89%的雄性来源样本具有这些模式。在肝癌中,差异更为极端,88%的女性表现出这种特征,而男性则为58%。

遗传分裂

布特罗斯说,这种偏见暗示了导致突变的过程中的基本生物学差异。这些差异让他的团队感到意外:“我们期待突变数量的差异,而不是类型,”他说。“例如,女性可能比男性更容易受到烟草烟雾的影响。我们没想到会有新的流程。“

结合起来,结果强调了性别会计的重要性,不仅在临床试验中,而且在临床前研究中,布特罗斯说。

Buetow说,这样做最终可以让研究人员确定布特罗斯及其同事发现的许多差异的根源。他的实验室发表了一份关于bioRxiv的预印本,该预印本可以发现肝脏肿瘤中基因活性的性别差异4。

在某些人群中,男性患肝癌的概率大约是女性的三倍,而且在某些国家,其发病率正在上升。“更好地了解其病因可能会变得非常重要,”Buetowsays说。“我们希望在预防策略和治疗方面超越我们的目标。”

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