“粪菌移植是重建肠道菌群的核心手段。”褚衍六介绍说，“粪菌移植疗效确切、副作用少、疗程短、复发率低，相比药物治疗，有非常明显的优势。”
所谓粪便移植就是字面上的意思：把粪便移植到另一个人的大肠里。正如“粪菌移植”这一学名所暗示的，真正发挥作用的不是粪便本身，而是其中的菌群。而粪菌移植的基本原理，是利用来源于健康人粪便的菌群，重建病人的肠道微生态系统。通过胃镜、肠镜、鼻-空肠管、造瘘口、灌肠等方法将健康者粪便导入患者肠道中，利用健康者粪便中存活的有益菌群化解一些超级致病细菌所导致的人体健康危机。
据威海市立医院中心实验室教授王明义介绍，人的肠道微生态系统极其复杂，一个健康人的肠道内约超过1000种细菌，总数达到100万亿左右。肠道菌群参与维持肠道的正常生理功能和机体免疫功能。近几年，粪菌移植技术因其奇特的方式和显著的效果成为医学界关注的热点。
据王明义介绍，该项技术可追溯到我国东晋时期葛洪《肘后方》中的“活龙汤”，明朝“医中之圣”李时珍也在《本草纲目》中有记载。国际上，粪菌移植首先应用于难辩梭状芽孢杆菌感染，目前研究已证明粪菌移植在伪膜性肠炎、炎症性肠病、肠易激综合症等肠道疾病治疗中的作用。
2013年，粪菌移植首次被写入美国胃肠病学杂志发表的难辨梭状芽孢杆菌感染的治疗指南。因此，粪菌移植被《时代》杂志评为2013年度“十大医学突破”、美国克利夫兰医学中心“影响2014年的十大医学创新”之一。
