HLA LOH指的是HLA杂合性缺失,HLA杂合性指的是在同源染色体上的一个或多个位点上有不同等位基因存在的状态。缺失(Loss of heterozygous,LOH),是基因变异导致正常的两个成对等位基因丢失其中一个等位基因的部分或全部基因组序列(此处存在一个丢失程度的问题,通常若肿瘤组织较正常对照组织出现某一基因条带消失或密度减少50%以上,可判断为缺失)。HLA LOH即指HLA成对等位基因丢失其中一个等位基因50%以上的基因组序列。 HLA LOH阳性代表着HLA基因存在杂合性缺失或功能完全缺失。由于HLA的功能是呈递新生抗原到细胞表面,供T细胞识别的,故一旦功能部分或者完全缺失,会导致抗原呈递能力缺失,免疫系统无法识别肿瘤的情况,即肿瘤易于免疫逃逸,也就是说这个患者可能存在对免疫药物耐药的风险。 HLA检测分为两个层面,一个是患者胚系HLA基因分型,目的是看患者HLA的多样性,另外一个层面是看肿瘤细胞的HLA基因是否因为免疫逃逸发生了杂合性缺失,前者检测的是患者的正常细胞如血液白细胞提取的DNA,后者检测的是肿瘤组织提取的DNA,HLA基因分型是HLA杂合性缺失分析的基础。 用于器官移植目的的血液HLA配型检测,和我们做的胚系HLA分型是一致的。我们对YuceOne® Panel和博奥(已通过国家CNAS认可,用于移植配型)Panel 检测HLA分型的结果进行比较,发现HLA-I 分型一致率96.67%,表明YuceOne ® Panel分型准确率高。 HLA功能失活是肿瘤免疫逃逸机制之一,故检测肿瘤细胞内部HLA基因是否突变或者杂合子缺失才能判断肿瘤是否对免疫药物耐药,所以不能用血液检测。血浆中虽然含有ctDNA,但是含量太低,检测准确度还有待提高。血液中的白细胞,只是代表正常细胞的HLA,不能代表肿瘤细胞中HLA功能是否完好。(HLA的功能有两方面:一个就是组织特异性抗原;另外一个是抗原呈递。所有有核的细胞,均表达HLA-Ⅰ型分子,均能呈递细胞内部产生抗原到细胞表面,供淋巴细胞识别。淋巴细胞一旦发现某个细胞呈递出来的抗原,人体之前没有,就会判读此细胞是异物,随着消灭掉。肿瘤细胞对于免疫系统来说,是异物,就是通过HLA-Ⅰ型分子呈递肿瘤细胞内部的新生抗原到细胞表面,供淋巴细胞识别、进而杀伤肿瘤细胞。但肿瘤是在免疫选择压力下,会丢失HLA-Ⅰ型分子,逃避免疫系统的杀伤,进而造成对免疫药物耐药。) 检测HLA难度较大,部分同行也开始检测HLA基因分型,但准确性无法评估。我们公司核心团队,参与过人类基因组计划,有中国人群HLA分型数据库。针对中国人群HLA分型,设计相应更适合中国人的HLA捕获探针,可分析HLA LOH,基于万人中国人群HLA单体型数据进行了HLA区域捕获探针的优化,HLA分型准确率和成功率更高;同步检测肿瘤样本(体系)HLA LOH和血液样本(胚系)HLA分型,相比只检测血液的HLA遗传多样性,还能反映肿瘤的抗原呈递功能,预测免疫耐药。目前我们公司是市面上唯一一家可以提供HLA杂合性缺失分析结果的检测公司。 |
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