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Nature | 末端炔基氨基酸生物合成通路的发现

 生物_医药_科研 2019-03-22

      生物正交反应通过使用生物体内缺乏的反应功能团,利用它们之间专一性反应实现选择性地原位标记。但是许多原本被认为生物体内不存在的官能团,例如氰基,烯基,炔基等逐渐在植物、真菌和微生物中被发现。本文报道了一条独特的细胞通路,可以产生末端连有炔基的氨基酸衍生物,该通路可用于非天然氨基酸的原位标记。

     首先作者基于对产生β-炔基丝氨酸的两种菌S. cattleya和Streptomyces catenulae和其它不产生该氨基酸的26种对照组Streptomyce spp.进行基因簇序列比较,发现四种独特的基因簇,并进行功能预测分析,猜测βes基因簇可能是目标基因簇。接下来,作者将该基因簇内的6个蛋白基因(βesA-E)逐一敲除并检验发现β-炔基丝氨酸和其前体β-炔基丙氨酸含量发生变化,从而验证了该猜想。

      在确定基因簇后,作者通过使用非靶标比较代谢组学检测besA-E各基因敲除后的代谢成分变化,结合蛋白体外纯化的in vitro检测,最终确定如图所示的代谢途径。由图可知,赖氨酸由BesD催化在4位发生氯取代反应,经BesC催化,发生非典型的甲醛氨基消除反应,再经过BesB催化消去氯代后生成β-炔基丙氨酸,在经过BesA、BesE催化等反应后生成β-炔基丝氨酸。

     作者将该体系与非天然氨基酸插入偶联,通过在同一E.Coil中表达BesB、C、D(产生β-炔基丙氨酸)和PraRS、GloEL-GroES(非天然氨基酸插入)从而实现了在蛋白质组中原位β-炔基丙氨酸的插入。

      综上,作者揭示了一条生物体内合成末端炔基氨基酸衍生物的生物途径,并将其应用在非天然氨基酸原位表达插入体系中。

本文作者:YS

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