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想要快速发表自己的第一篇 SCI，应该是很多科研工作者朝思暮想的事情，但是，实验总不顺怎么办？ 别怕，今天就教你如何快速在不做实验的情况下发表属于自己的第一篇 SCI。（文末彩蛋） 以一篇影响因子 3.152 的文章为例，从投稿到接受并发表不到三个月时间，而且全文无需做实验，是不是很羡慕啊？ 文章题目 : Co-expressionmodules construction by WGCNA and identify potential prognostic markers ofuveal melanoma
杂志 : ExperimentalEye Research；IF=3.152 这是一篇完全基于生物信息学分析的文章，到底做了什么工作，让我们看一下吧。
1. 首先，利用 R 包 flashClust 对在 TCGA 上下载的 80 个样本的转录组信息进行聚类分析，获得样本之间的相关性。 2. 接下来，利用 R 包 WGCNA 把输入的表达矩阵的所有基因归类成了二十一个模块，分别以不同的颜色表示。大体思路：计算基因间的邻接性，根据邻接性计算基因间的相似性，然后推出基因间的相异性系数，并据此得到基因间的系统聚类树。 3. 然后，对已经得出的 21 个模块进行共表达模块的交互作用分析并随机选择基因绘制热图。 4. 计算各个基因模块与临床特征的相关系数。 5. 模块的聚类图及性状与模块的热图。
6. 利用 DAVID 数据库，对具有显著相关的四个模块中的基因进行 GO 通路富集。 7. Cytoscape 对四种模块中的基因构建相关网络图。
综上：分析 TCGA 数据库中的数据——利用 R 语言的WGCNA 包——结合在线工具——发表文章，3 步搞定一篇 3 分文章。
心动了吗？ 你也可以。 丁香园特邀 CNS 一作张旭东老师开展生信速成班：R语言与表达数据挖掘专题培训，通过 3 天的培训即可自行完成转录组基本分析以及表达数据的深度挖掘与绘图。
主办单位：丁香园 课程名称：R 语言与表达数据挖掘专题培训班 时间：5 月 11 日～5 月 13 日 地点：上海市闵行区申长路虹桥绿谷 B 幢负 1 楼 |
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