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这么一个浓眉大眼的LncRNA数据库,居然也只能用来查查文献

 生物_医药_科研 2019-04-16

lncRNA的数据库也有蛮多,但是这个跟肿瘤相关的数据库,确实……确实也没什么好讲的。这是一个只能用来查文献的数据库……

因为改版了一下,实际上和标题一样,就是研究lncRNA和肿瘤的数据库,你可以认为这是一个集芯片差异表达和肿瘤LncRNA文献文本分析的分析工具。那我们能用这个数据库,挖掘什么样的信息呢

首先是不同的肿瘤相关的LncRNA:

点击到肿瘤图标就能直接进入到与该肿瘤相关的LncRNA上了

我点了个胃癌,然后,就是和胃癌相关的所有LncRNA名称,以及表达模式,研究的方法和文献等等。

夏老师看了一下,浏览实际上也玩不出什么花样了,就是LncRNA找相关肿瘤,或者肿瘤来找相关LncRNA:

但是,搜索的高级功能,就有点不一样了:

可以对肿瘤或者LncRNA进行限制,找出LncRNA调控的表型,比如耐药性,以及已有与其他调控机制之间的关系,比如TF或者miRNA,甚至还能细分研究方法:

当然,肠癌中与耐药相关,并且表达上调,还有相关转录因子研究的,就只有一个LncRNA:

实际上是作为ceRNA调节转录因子的,这也算是转录因子的研究吧:

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