如何花5分钟给你的Paper加几张Figure？

TCGA的神器这么多，据白介素同学所知，能够做 TCGA蛋白数据挖掘目前寥寥无几，好用的暂时木有发现，原因是啥，也不清楚。最近出了一个网页版 TCGA蛋白数据挖掘神器，下面来看下，有啥功能：

假设你对某个蛋白感兴趣

 

发表级图片，可供下载，直接放到Paper里的

查看某种肿瘤中与预后相关的蛋白，当然啦，仅限于 TCGA的蛋白数据，已火山图的形式展示：

 

第三种应用功能：想了解一下某个蛋白在各种肿瘤中的预后情况，同样以火山图的形式展示，可以直观的看到某个感兴趣的蛋白的预后情况，与哪几种肿瘤相关呢？

比如下面这张图，展示的是这个蛋白与 ACC和PRAD这两种肿瘤预后关系最明显，横轴表示的是 log HR，纵轴表示 -log10(pvalue)

 

同样的有柱状图展示：

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补充一下，这个神器能完成各种临床参数的选择，还能选择 OS， DFS等，可交互式调节 lable。 要说有没有缺点？

唯一的缺点，就是速度比较感人。

但是功能强大，堪称神器，TCGA蛋白数据挖掘，就交给这个神器吧!

另外聊一下这个神器的背景，2018年发表在 F1000Research上，去年10月经过了revise，现在是第二版。

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今天就聊到这吧，还不快去试试看！白介素同学祝大家周末愉快！

 

神器网址：

https://nborcherding./TRGAted/

参考文献：

https:///articles/7-1235/v2