在GEO数据库找到了疾病芯片后,差异分析的结果很赞,同时也发现有很多差异基因,这时候的你是不是很开心!但是问题来了,在茫茫的差异基因中,哪一条基因才最有可能参与了疾病的发展呢? 没关系,小编今天放大招,教你如何利用疾病已知基因快速确定研究对象。 首先做个基因关联分析,如下图所示,这样就能清楚的就知道哪个基因最核心。 确定核心基因后,发现芯片分析中的差异基因并不是每一个都跟疾病相关又或者关联分析出来的核心基因跟疾病关联不大又该怎么办呢? 这时候你只需要在差异基因中加入疾病已知基因,(就是那些已经有过很多研究被很多文献证明与疾病有关的基因),然后再做关联分析,就可以把那些跟疾病关系不大的差异基因排除了。 最后一步,怎么获得疾病相关的已知基因呢?难道要去pumbed上慢慢检索吗?答案当然是不用! 用之前小编推荐过的6个在线数据库,可以让你轻松解决疾病相关已知基因检索问题! 6个在线数据库,文章在这里↓↓↓ 另外还有2个疾病相关miRNA和lncRNA检索数据库 1 、疾病相关 miRNA 检索: http://www./ 2 、疾病相关 lncRNA 检索: http://www./lncrnadisease 获得差异基因和疾病已知基因后,就可以做上面那个看起来很厉害的关联图了,链接在这里:https:/// 超简单的使用方法: 1、点击链接(https:///) 进入网站后,选择Multiple proteins,在list of names中输入基因名,在organism中选择物种为人类。 2、点击SEARCH,核对一下选择基因名称对不对,然后点击CONTINUE。 这样基因关联图就做好了,是不是超简单!(快夸我)
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