高通量测序技术的发展使得数据的获取越来越容易; 生物信息的发展为解析数据提出假说提供了很好的技术手段; 易生信培训搭建了很好的桥梁; 数据有了,分析结果有了,文章发表了,皆大欢喜! 来生信宝典和宏基因组做个推广,让更多同行知道自己的工作吧; 然后呢?为我们出力的数据怎么处理? 鸟尽弓藏,兔死狗烹? 让他们蜷缩在Excel里? 让他们沉睡在服务器上? 还是杯酒释兵权,给他们个安乐窝,继续发挥余热? 提供个在线平台让数据好好组织起来, 方便实验室以后的查询、分析和使用? 或者成为自己研究领域的标准库? 亦或是发表一篇11分的NAR文章? 下面就是2个很好的例子。 中医药方剂的数据库,收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息, 网站古色古香,设计精美,交互探索,网络大气, 高颜值是很好的敲门砖, 于2018年发表于NAR杂志。 表格展示太枯燥,关键信息交互式饼图展示,查看,点击筛选~~ 现在数据库升级第二版,更多功能,更多展示 (网络图比下面这个更漂亮,更有生物意义,更有交互性,只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o)。 另一个是`Prophage hunter`,在细菌基因组中寻找活性噬菌体。 页面极简,但设计精良,定制基因组浏览器交互, 于2019年发表于NAR杂志。 表格和基因组浏览器的双向控制 做的更多的还是分子数据的展示,如转录组相关数据的展示。 首先展示下首页,专业设计师私人定制,可以传统,可以现代;可以功能为主,也可以轮播酷炫。
那搜索一下,都展示哪些信息? 基因,别名,公共数据库链接,功能注释,表达分布,PPI网络,共表达网络,想放啥放啥! 一个基因嫌少,来绘制一组基因的表达谱,修饰谱;同时展示甲基化修饰与基因表达的关系。 图就不展示了,绝对心中所想! 搜索太简单了(其实功能很强大),可否更多条件搜索? 多组学如何展示?基因组浏览器可否嵌入? 基因组浏览器是多组学的展示利器,更多见: ChIP类数据同时展示 展示同源物种,也可以~ 更多在线功能,样品聚类、筛选、差异基因(样品特异性基因)、功能富集 (一个小的云平台出来了) 更多交互式图,染色体图谱、饼图、箱线图、交互式表 数据库收录样本信息更多互动展示 这也是一个主页风格,随您定制。 更多地图展示 时间轴变化来一个 访问量统计页来一个 (这是高颜值可定制在线绘图工具-第三版的用户访问,总访问量近10万,给您做个友情链接,也能推广带动访问) 以上列出一部分,更多数据库还在建设中,发表后慢慢释放,更多展示和需求也等您提出。 |
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