泛素化是指泛素在一系列酶的催化下对靶蛋白进行特异性修饰的过程,它被认为是蛋白质翻译后修饰的一个重要途径,在细胞凋亡、细胞周期调控、DNA损伤修复及膜转运等细胞过程中起重要作用。 一、套路总结 1、从下游找上游 2、从上游找下游 二、高分(IF:41.577)文献剖析 FBXO38 mediates PD-1 ubiquitination and regulates anti-tumour immunity of T cells.Nature. IF:41.577 FBXO38 mediates PD-1 ubiquitination and regulates anti-tumour immunity of T cells.Nature. 2018 Dec;564(7734):130-135. 1、机制图展示 在正常激活的T细胞中的IL-2信号传导导致STAT5介导的Fbxo38基因表达的转录激活。FBXO38蛋白募集泛素(Ub)修饰内化的PD-1,使PD-1的蛋白酶体降解。T细胞表面上低丰度PD1可最终促进抗肿瘤免疫反应。 2、文献解读 PD-1在蛋白酶体中被泛素化降解 三种不同T细胞PD-1表达水平-时间变化曲线:激活后的T细胞2天PD-1表达到峰值,之后开始降解,激活后T细胞中PD-1转录水平下降不明显。 IP实验发现PD-1和泛素相互作用,暗示PD-1被泛素化。 蛋白酶体抑制剂MG132可抑制PD-1的降解; 溶酶体抑制剂NH4Cl则不能。 FBXO38介导PD-1的Lys48位泛素化降解 IP实验验证:PD-1和FBXO38存在相互作用。 只有同时表达PD-1和FBXO38才可观察到PD-1泛素化; 调高FBXO38,PD-1泛素化升高,调低则泛素化降低。 FBXO38调节T细胞抗肿瘤免疫力 敲除FBXO38的小鼠种瘤之后肿瘤生长更快、小鼠存活时间缩短。 敲除FBXO38后,CD4和CD8 T细胞PD-1表达升高,效应分子阳性CD8 T细胞比例降低,CD8 T细胞增殖能力降低。 IL-2在肿瘤微环境中拯救Fbxo38的表达水平 除CD3、CD28抗体激活外,在加入IL-2可进一步提高FBXO38的表达。 ChIP发现IL-2能促进STAT5(IL2的下游)结合到FBXO38的Enhancer和Promoter上 -IL-2促进FBXO38转录的机制。 体内实验证明:IL-2可通过促进FBXO38的转录,抑制PD-1的表达,进而抑制肿瘤的生长。 3、技术路线图 三、低分(IF:6.491)文献剖析 Long non-coding RNA SNHG15 interacts with and stabilizes transcription factor Slug and promotes colon cancer progression. IF:6.491 Jiang Hao,Li Tingting,Qu Yi et al. Long non-coding RNA SNHG15 interacts with and stabilizes transcription factor Slug and promotes colon cancer progression.[J] .Cancer Lett., 2018, 425: 78-87.. 1、机制图展示 LncRNA SNHG15与Slug的C末端结构域结合,掩蔽蛋白化位点可阻止BTRC介导的Slug泛素化降解。导致Slug蛋白表达上升,诱导结肠癌中的EMT和/或肿瘤细胞增殖。 2、文献解读 差异表达的lncRNA比较分析 通过GEO数据库数据挖掘,结合PCR验证结果,排除已经有研究报道的lncRNA,最终挑选了SNHG15这一lncRNA。 LncRNA SNHG15在癌症中失调 LncRNA SNHG15与癌症不良预后相关,LncRNA SNHG15在癌症中高表达。 LncRNA SNHG15促进结肠癌细胞迁移 在细胞表型研究中,作者发现SNHG15能够显著促进结直肠癌细胞的迁移。 LncRNA SNHG15与结肠癌细胞中的Slug相互作用 IP和RNA pull-down实验验证LncRNA SNHG15与Slug相互作用。 确定SNHG15中的Slug结合域 ,Flag-Slug受外源lncRNA SNHG15调控。 LncRNA SNHG15通过阻止Slug泛素化来稳定Slug lncRNA SNHG15上调Slug蛋白水平,对mRNA水平无影响。 验证LncRNA SNHG15是通过蛋白酶体降解防止Slug降解。 验证SNHG15能够抑制BTRC(E3泛素连接酶)介导的Slug的泛素化降解。 LncRNA SNHG15促进体内肿瘤生长 3、技术路线图 |
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