32个常用的生信在线工具

在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，因此深受科研人员的喜爱。基迪奥生物公众号已持续为大家分享过很多在线工具的使用教程，这里做个简单的整理。

RNA二级结构

1

Mfold

工具链接：

http://unafold.rna./?q=mfold

2

RNAfold

工具链接：

http://rna.tbi./cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

蛋白互作网络

3

String

工具链接：

https:///

基因共表达网络

4

Coexpedia

工具链接：

http：//www.coexpedia.org/

序列Motif

5

MEME

工具链接：

http:///

6

Weblogo

工具链接：

http://weblogo./

基因信息查找

7

Genecard

工具链接：

http://www.

序列展示

8

ESPript

工具链接：

http://espript./ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi

Gene ID转化

9

BioMart

工具链接：

http://www./index.html

10

g:profiler

工具链接：

https://biit.cs./gprofiler/convert

韦恩图

11

Venny2.0

工具链接：

http://bioinfogp.cnb./tools/venny/index.html

12

OmicShare 韦恩图工具

工具链接：
http://www./tools/Home/Soft/venn

三元图

13

Ternary plot maker

工具链接：

https://www./

基因结构分析

14

FGENES

工具链接：

http:///

范例结果：

系统发育分析

15

iTOL

工具链接：

https://itol./

16

Evolview

工具链接：

http://www./evolview/

启动子预测

17

Promoter Scan

工具链接：

http://www.cbs./services/Promoter/

蛋白一级结构预测

18

PredictProte

工具链接：

https://www./home

19

ProtParam tool

工具链接：

http://web./protparam/

信号肽预测

20

SignalP

工具链接：

http://www.cbs./services/SignalP/

跨膜结构域

21

TMHMM Server v. 2.0

工具链接：

http://www.cbs./services/TMHMM/

亚细胞定位

22

PSORT

工具链接：

https://www./

蛋白三级结构预测

23

SWISS-MODEL

工具链接：

https://swissmodel./

24

Phyre2

工具链接：

http://www.sbg.bio./phyre2/html/page.cgi?id=index

短序列拼接

25

Cap3

工具链接：

http://doua./software/cap3

GO富集分析

26

OmicShare GO富集分析工具

工具链接：

http://www./tools/home/report/goenrich.html

KEGG富集分析

27

OmicShare KEGG富集分析工具

工具链接：

http://www./tools/home/report/koenrich.html

趋势分析

28

OmicShare 趋势分析工具

工具链接：

http://www./tools/Home/Soft/trend

蛋白结构域预测

29

Pfam

工具链接：

http://pfam./search

基因组杂合性评估

30

GenomeScope

工具链接：

http://qb./genomescope/analysis.php?code=example2

圈图

31

CIRCOS

工具链接：

http://mkweb./tableviewer/visualize/

热图

32

Omicshare热图工具

工具链接：

http://www./tools/Home/Soft/heatmap