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2013年美国C.Y.Chiu教授首次应用mNGS技术诊断了14岁小男孩的钩端螺旋体脑病并挽救了他的生命，引起了全球神经科医生对mNGS技术在病原体检测方面应用的巨大兴趣，并着手进行了探索性研究。2016年在中国，西赵钢教授率团队启动了国家十三五精准医学重点专项《脑膜（脑）炎的分子分型》，在两年内完成了全国近10000份脑脊液的测序工作。近期美国C.Y.Chiu教授在NEJM及中国关鸿志教授联合国内多家医院和华大基因在BioRxiv连续发表的mNGS技术脑（膜）炎及脊髓炎的应用测评相关文章，预示着mNGS技术在中枢神经系统感染的诊断进入了应用阶段。 神经科临床医生该如何应用这种技术帮助日常诊疗，高效送检，如何判断阳性、区分假阴性及假阳性呢？结合以上两篇文章，本篇评论对这些问题提出一些自己的看法和想法。 1、疑诊中枢神经系统感染的患者符合什么样的标准时，适合送检mNGS病原学检测？ 关鸿志教授文章中明确提出脑炎及脑膜炎入组标准[1]： 结合2016年细菌性脑膜炎诊治指南及我们实际测序经验，推荐送检指标如下，如出现以下症状（>2条）： 头痛，发热，脑膜刺激征，精神状态改变；实验室检查：脑脊液白细胞计数>10/mm3，或影像学提示脑炎可能； 2、免疫缺陷病人如出现发热伴意识状态改变/癫痫样发作，应立即使用mNGS技术检测。 除以上标准之外，个人认为免疫缺陷病人如出现发热伴意识状态改变/癫痫样发作，应立即使用mNGS技术检测。 主要原因： a. 此类病人病情较重需及时诊断启动治疗； b. 其感染病原的疑难程度较复杂（医院获得性和社区获得性均可能且前者可能性更多），且病程的不同阶段感染的病原体可能不一样，多种病原体混合感染的可能性也较大。所以如早期使用mNGS技术可尽早且全面的展开精准治疗。 关教授及Chiu教授均指出：长期使用抗生素，导致mNGS的检出率降低；此外，血液污染的CSF标本，或脑脊液细胞数>200/mm3等因素也会影响mNGS检出效力。送检医生应重点关注这些影响因素。 3、将mNGS列入普通脑炎的二线检查，疑难及反复发作性脑（膜）炎的一线检查方法。 Chiu教授提出在美国mNGS技术当作疑难病例的备检测方案。关教授文中提出mNGS可考虑作为不典型脑（膜）炎的一线方案；个人推荐将mNGS列入普通脑（膜）炎的二线检测手段，疑难及反复发作性脑（膜）炎的一线检测手段。 目前缺乏针对中枢神经系统感染有效的病原体多重PCR检测方案。如结合临床症状有一定的病原筛查范围，可在PCR筛查基础上再应用mNGS。
未完待续… 下一期内容更实战 后言 在临床应用探索阶段，神经科医生通过一些个案及小样本研究结果逐步认识了mNGS技术，这种技术可以在一次送检中高效快速的对上万种病原体进行筛查，在检测效率上大大的优于传统的病原体检测方法，这包括了镜检，培养，抗原抗体及靶向PCR技术。 简单回顾其时间线，2013年，C.Y.Chiu教授第一次成功应用mNGS技术为一位不明原因发热的小男孩确诊钩端螺旋体脑炎。2014年，中国协和医院的关鸿志教授证实了mNGS技术在人类疱疹病毒脑（膜）炎的可行性。2017年，中国华山医院的张文宏教授更是应用mNGS技术还原了伪狂犬病毒跨物种感染人类的证据链。2019年，C.Y.Chiu教授团队再次应用mNGS技术帮助一名反复脊髓炎发作14年的患者提供了囊虫的诊断依据，并指导治疗有效。 成功的案例还有很多，从这么多成功多案例中得以证实：mNGS技术确实可以为临床中枢神经系统感染患者提供一些帮助。 [1] Clinical Metagenomic Sequencing forDiagnosis of Meningitis and Encephalitis. Wilson, M. R.,S.Miller and C. Y. Chiu. N Engl J Med380(24):2327-2340.(2019). [2] Metagenomic Next-generation Sequencing of Cerebrospinal Fluid for theDiagnosis of Central Nervous System Infections: A Multicentre Prospective Study. Siyuan Fan,Xiaojuan Wang, Hongzhi Guan MD1. BroRxiv (accept) Jun. 10, 2019; doi: http://dx./10.1101/658047. 予果微码，让微生物检测更简单！ Make Microbial Identification Easier 长按关注：予果微码，提供mNGS病例库及知识库  |
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