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作者：小丫 来源：嘉因 同样算read counts，为什么公司跟师兄算的结果不一样？| Ensembl、UCSC、Refseq，该用哪个一文推荐用ensembl的gene model，哪些已经测序的植物有ensembl基因组注释呢？
列在这里，加上了中文名和汉语拼音，便于小伙伴儿们查找。
| Species | 中文名 | | Aegilops tauschii | 节节麦 | | Amborella trichopoda | 无油樟 | | Arabidopsis lyrata | 琴叶拟南芥 | | Arabidopsis thaliana | 拟南芥 | | Beta vulgaris | 甜菜 | | Brachypodium distachyon | 二穗短柄草 | | Brassica napus | 油菜 | | Brassica oleracea | 甘蓝 | | Brassica rapa | 白菜 | | Chlamydomonas reinhardtii | 莱茵衣藻 | | Chondrus crispus | 皱波角叉菜 | | Corchorus capsularis | 圆果黄麻 | | Cyanidioschyzon merolae | 红藻 | | Galdieria sulphuraria | 红藻 | | Glycine max | 大豆 | | Hordeum vulgare | 大麦 | | Leersia perrieri | 假稻属 | | Medicago truncatula | 蒺藜苜蓿 | | Musa acuminata | 小果野蕉 | | Oryza barthii | 稻属 | | Oryza brachyantha | 花药野生稻 | | Oryza glaberrima | 非洲栽培稻 | | Oryza glumaepatula | 展颖野生稻 | | Oryza indica | 秈稻 | | Oryza longistaminata | 长雄野生稻 | | Oryza meridionalis | 南方野生稻 | | Oryza nivara | 野生稻 | | Oryza punctata | 斑点稻 | | Oryza rufipogon | 野生稻 | | Oryza sativa | 稻 | | Ostreococcus lucimarinus | 鞭毛藻 | | Physcomitrella patens | 小立碗藓 | | Populus trichocarpa | 杨树 | | Prunus persica | 桃 | | Selaginella moellendorffii | 江南卷柏 | | Setaria italica | 小米 | | Solanum lycopersicum | 番茄 | | Solanum tuberosum | 马铃薯 | | Sorghum bicolor | 高粱 | | Theobroma cacao | 可可树 | | Trifolium pratense | 红三叶草 | | Triticum aestivum | 小麦 | | Triticum urartu | 乌拉尔图小麦 | | Vitis vinifera | 葡萄 | | Zea mays | 玉米 |
用ensembl基因组的理由： 
同样用Ensembl算TPM，结果还是不一样？ | Ensembl的注意事项
http://blog.sciencenet.cn/blog-3372875-1090618.html
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