这是一个病例对照研究,总共37名研究对象。其中,遗传性肌肉病患者25名;非遗传性肌肉病患者8名,健康对照4名。研究者用Western blot 和immunoblot 检测了骨骼肌样本中 mTOR 通路中2个关键蛋白的磷酸化,作为反映mTOR通路活性的指标。 第一个小节是伦理审批,第二个小节是病人和活检。本文重点解读方法部分。 先上方法部分原文: 第三小节是:Western blotting 总共六句话。 第一句话: Western blotting was performed on muscle homogenates. 第二句话: Aliquots containing 20-mg protein were loaded onto a 10% sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel for electrophoresis. 第三句话: Proteins were transferred to polyvinylidene fluoride (PVDF) (Bio-Rad, USA) for 1.5 h at 100 V, 4°C. 第四句话: All the total and phosphorylated antibodies, such as S6 and p70S6K, were obtained from Cell Signaling Technology (USA), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase was used as internal standard control. 第五句话: The signal was detected by enhanced chemiluminescence using a Western blotting luminol reagent (Merck Millipore, Germany). 第六句话: The mean gray values of protein bands were measured by Image J 1.46r software (National Institutes of Health, USA). 这几句话,文字层面上没有太大问题,不影响理解,但是在内容的取舍方面不及格:该说的事没说,用不着说的说了一堆。 大家知道:用 Western blot 检测蛋白,最关键的是一抗,如果一抗来源不靠谱,结果就不靠谱。即使是来自靠谱的同一家公司,也有不同货号的抗体,有些合适而有些却不合适。若一抗选对了,具体的孵育条件还有很多讲究,浓度不能太高也不能太低,孵育时间不能太长也不能太短,温度不能太高也不能太低。这些都是关键条件,必须在论文的方法部分详细地交代。大家再看这几句话,作者除了购买一抗的公司名称,别的什么都没说,倒是花费了大量的篇幅描述了很多鸡毛蒜皮的事情,比如 protein transfer 使用的具体电压和时间,这就本末倒置了。本末倒置不说,别人无法相信你的结果是可靠的。 第四小节是 Muscle pathology 肌肉病理,总共三句话。 第一句话: Frozen muscle samples were sliced into 6-mm-thick serial sections. 第二句话: For histological examination, serial sections were stained with hematoxylin and eosin (HE), succinate reductase (SDH) and cytochrome C oxidase (COX) (S/C), oil red O (ORO) and periodic acid Schiff (PAS). 第三句话: Immunohistochemical study with phosphorylated S6 ribosomal protein (p-S6) rabbit monoclonal antibody (diluted in 1:200) were performed with routine protocol. 这几句话在文字层面上的问题也不大,但是,内容不对,第三句话描述的东西是磷酸化S6的免疫组化检测,是作者的研究目的,反映的是骨骼肌中mTOR通路的活性,根本不是什么肌肉病理,这是关键的检测指标。应当和前面用 Western blot检测mTOR通路中2个关键蛋白的磷酸化活化放在一起,重新起一个小标题叫“mTOR pathway activity”,而肌肉病理这个小节只说真正的病理,不说mTOR通路活性的检测。 换句话说,论文方法部分模块的组织是应当按照研究的思路进行安排,而不是按照具体的技术方法去组织,描述的是按照研究的线路走,而不是按照被你具体的技术方法牵引着走,这样的描述读者更容易理解你的研究方法。 |
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