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「学转录组入门生信」第四周根据差异基因进行富集分析及解读

 生物_医药_科研 2019-07-29

本周的学习简单来说可以分为两个阶段:

第一阶段:一代富集分析——GO和KEGG
  1. 使用biomaRt包注释差异基因

  2. 使用ClusterProfile包对差异基因进行富集分析

  3. GO分析及结果解读

  4. KEGG分析及结果解读

  5. 使用ggplot2包对分析结果作图

第二阶段:二代富集分析——GSEA
  1. 输入文件的格式解读与构建

  2. GSEA参数的选择与基因集的构建

  3. 常见报错原因解读

  4. 结果解读

  5. 生物学意义解析

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