Beta 先看纵向:present/absence: Abundance: 基于微生物均匀度(相对丰度)计算距离矩阵,主要决定于样品中相对丰度较高的物种,相对丰度低的稀有OTU对结果影响较小; 如何选择: 相反的话jaccard和非加权的unweighted unifrac距离矩阵更好一些; 再横着看:算法Unifrac距离法,是根据系统发生树进行比较,会根据16s的序列信息对OTU进行进化树分类, 因此不同OTU之间的距离实际上有“远近”之分。而其他距离算法认为OTU之间的关系是平等的。 如下图所示: |
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