2019-08-06 09:51:01Haalthy导读 靶向治疗前需要进行基因检测,查找突变的基因,从而选择合适的药物。但是在基因检测报告上,不仅仅有基因突变的类型,还有一项重要的参考项目:突变丰度。 基因突变丰度是什么呢?丰度值的高低有统一标准吗?丰度值高好还是低好呢?想知道这些问题,一起看下今天的文章吧。 基因突变丰度是什么?拿到一份基因检测的报告,我们常常可以看到一项参考数值:丰度,这个数据令很多病友不解,“丰度”究竟是什么呢?以肺癌中最常见的EGFR突变为例: “丰度”可以简要理解为EGFR突变频率占总的DNA中的浓度,也有学者将丰度定义为EGFR突变和野生型拷贝的比值,目前没有明确的定义。 为什么不同的患者突变丰度不同?不同的患者基因检测的突变丰度会有很大的差异,这种差异主要与肿瘤异质性相关,过去我们认为同一个体中肿瘤细胞是相同的,基因相同、空间结构也相同;然而,随着检测技术逐渐精准化,我们才发现同一份样本组织中,肿瘤细胞的基因、蛋白等各个结构并不一致。 这种特征更通俗而言,可以用一句古语表达“一母生九子,九子各不同”,原来定居的肿瘤细胞不断演变出不同的后代。同一部位肿瘤会产生不同的基因表达,不同部位的肿瘤表达又有可能出现新的改变,不同人之间又会有区别,从宏观上看是人和人不同,微观上看肿瘤和肿瘤也不同。 也就造成了不同的患者即使具有相同的基因突变,彼此之间突变的丰度也会有所不同,进而表现为对于同一种药物的反应也不同。 高、低丰度判断标准早期,丰度高低的定义与基因检测方法敏感性有关,如直接测序法需要EGFR突变频率达到20%-30%才能发现,而ARMS检测只需要EGFR突变频率达到1%即可检测到。只要检测到突变即为高丰度。但这种定义过于笼统化,不具有区分性。 但目前对于基因检测的丰度高低值判断仍旧没有统一的区间标准。不同的测序方法、不同的检测公司会有不同的数值设定。 基因突变丰度高可能提示TKI治疗效果好有中国学者发现EGFR突变丰度可以预测EGFR- TKI治疗晚期非小细胞肺癌的疗效。研究选取了100个样本,其中有51例EGFR突变患者丰度较高,18例EGFR突变患者丰度较低,31例患者携带野生型EGFR。 将这100例患者同时进行直接DNA测序和ARMS检测, 两种方法检测均为阳性则为EGFR突变高丰度; ARMS检测阳性、直接DNA测序为阴性则为低丰度; 二者均为阴性则为携带野生型EGFR。 所有患者均接受吉非替尼治疗,检测标本肿瘤细胞超过50%。分析了EGFR突变丰度与吉非替尼治疗临床疗效的关系结果如图所示: 图一:EGFR突变丰度高、EGFR突变丰度低和EGFR野生型三者比较 中位无进展生存期(mPFS) 11.3个月 vs 6.9个月 vs 2.1个月; 客观缓解率(ORR) 62.7% vs 44.4% vs 16.1%; 总生存期(OS) 15.9 个月 vs 10.9个月 vs 8.7个月 由此得出,基线相对EGFR突变丰度可以预测TKI 获益程度。突变丰度越高,也就越有可能获益。 对于该研究的三个延展性问题 结果有差异 由于肿瘤异质性、基因检测的方法、获取的标本、研究者关于丰度的定义等因素并不统一,因此不同试验会得出不同的结论。 如,有研究者用同样的方法,结果发现高低丰度患者对TKI反应没有显著不同,直接测序和ARMS法检测突变结果不同的患者和相同的患者,PFS分别是13.4和10.9个月,没有显著统计学差异,可能与该试验的标本选择有关。 总之,EGFR基因突变丰度高可能提示EGFR-TKI治疗效果好,但二者之间不存在必然关系。 丰度动态变化也可以反应TKI治疗效果 有研究显示:血浆中EGFR突变快速降低可能预示更好的TKI反应。FASTACT-2研究显示第3周期时血浆EGFR突变依旧阳性可能预示较差的临床结局。 其他基因突变丰度是否具有相同的结论 目前,没有资料显示其他基因突变丰度对于靶向治疗效果的研究,因此,能否将同样的结论类比到其他的基因突变丰度,尚待考量。 以上是肺腾助手为病友们整理的基因检测突变丰度的小知识,希望对大家有帮助! 参考资料: [1].https:///doi/pdfdirect/10.1200/JCO.2010.33.3757 [2].邵宜,钟殿胜 .EGFR突变丰度的检测及其临床意义[J].中国肺癌杂志,2017,20(8):578-582 |
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