N⁶-甲基腺苷(m⁶A)修饰是真核细胞中最丰富的RNA修饰,参与了RNA的翻译、降解、亚细胞定位、选择性剪接和等多种生物学过程。近年来,人们发现m⁶A在哺乳动物神经系统的mRNA中普遍存在,并在胚胎期和产后神经元发育过程中表现出动态特征。浙江大学医学院李学坤教授团队在今年4月发表的最新研究“m⁶A Regulates Neurogenesis and Neuronal Development by Modulating Histone Methyltransferase Ezh2”揭示了m⁶A甲基化修饰在神经元发育和成体神经形成中的作用。 研究结果 1、在sNSC(成体神经干细胞)分化过程中,Mettl3和m⁶A的表达呈现动态变化 研究者从成年野生型小鼠的前脑中分离出aNSCs(成体神经干细胞),发现在aNSC分化过程中,Mettl3和Mettl14的表达显著升高。RNA斑点免疫印迹法检测发现m⁶A的水平,增殖分化的过程中也显著升高。(图1) 图1 2、Mettl3在神经元的发育过程中的功能 为了研究Mettl3在aNSCs增殖分化中的功能,研究者采用慢病毒转染shRNA敲低小鼠aNSC中的Mettl3。发现敲低Mettl3显著降低了整体的m6A水平,且aNSCs增殖受到抑制。(图2) 图2 另外,敲低Mettl3抑制了aNSC细胞的增殖,并且导致细胞周期失调,但不影响aNSC的同质性(图3)。 图3 接下来,研究者发现敲低Mettl3减少Tuj1+神经元细胞的数量,且其细胞标志物的启动子活性也降低了,而对GFAP+胶质细胞的数量和标志物的启动子活性影响相反。而且敲低Mettl3后,新生神经元的树突分支数和树突总长度均明显减少,Mettl3过表达的情况则恰好相反。体外实验观察到了同样的现象。综合以上结果表明,Mettl3在调节aNSC细胞分化的过程中存在谱系定向,偏向于调节神经元的分化,并且在体内和体外都能促进神经元的发育。 3、m⁶A修饰转录产物参与神经形成和神经元发 为了系统阐明m⁶A在神经形成和神经元发育中的作用,研究者采用MeRIP-Seq结合RNA测序,探讨m⁶A在aNSCs细胞增殖样本和细胞分化样本中的基因表达和甲基化情况。MeRIP-Seq结果显示有6569种基因在两组样本间重叠,GO功能分析发现这些重叠基因的功能主要与转录、神经形成、神经元分化和细胞周期有关。在细胞增殖样本特异性表达的基因在DNA复制、细胞周期中富集,而在细胞分化样本特异性表达的基因在神经形成、神经元发育分化方面富集。结合RNA测序结果,发现表达变化并发生m⁶A修饰的基因也在细胞周期、神经系统发育和神经元分化相关的通路中富集。这些数据表明m⁶A修饰在调控aNSCs基因表达中起着关键作用(图4)。 图4 通过MeRIP-Seq结合RNA测序比较对照组和Mettl3敲低组的aNSC中基因的表达和m⁶A修饰分布模式。GO功能富集分析和IGV图像表明,m6A修饰的上调基因主要与神经元分化、神经形成和神经系统发育有关;m⁶A标记下调的基因主要参与神经发育(Vegfa、syt4)和细胞增殖(Tet1、E2f7)(图5)。 图5 4、Ezh2可以修复Mettl3缺失引起的神经形成和神经元发育缺陷 之前有研究表明,组蛋白甲基转移酶Ezh2在神经形成和神经元发育中发挥了重要的作用。因此研究者在Mettl3缺失的aNSCs中过表达Ezh2,结果增加了BrdU+细胞的数量,促进了神经元分化,新生神经元的树突数量和长度也随之增加。综上所述,Ezh2过表达可以挽救Mettl3缺失所引起的神经形成和神经元发育缺陷。 全文总结 1、Mettl3缺失显著降低aNSC的m⁶A水平,抑制了aNSC的增殖; 2、Mettl3缺失抑制神经元的发育,使神经干细胞向神经胶质谱系分化,影响成年脑新生神经元的形态成熟; 3、MeRIP-Seq显示,m⁶A主要富集于与神经形成和神经元发育相关的转录本; 4、Ezh2过表达可以修复Mettl3缺失引起的神经形成和神经元发育缺陷。 华银健康高通量测序检测中心可提供m⁶A甲基化测序以及相关科研服务 华银健康高通量测序检测中心 中心定位于科研服务与临床医学转化应用,致力于生物医学各领域的相关研究与测序大数据联合分析,为各大高校、医院和科研单位提供医学科研项目的实验设计、测序方案和数据分析为一体的一站式服务。形成以临床应用为导向的转化医学中心,力争为客户提供专业、快速的临床医学检测服务。 目前,华银高通量检测平台拥有Illumina和Thermo Fisher等高通量测序仪组成的大规模高通量测序服务平台,科研服务可提供涵盖外泌体组学、免疫组学、基因组学、转录组学、微生物组学、和代谢组学等各种测序服务和高级生物信息分析服务;临床检测服务包括遗传性肾病全谱基因检测、临床病原微生物检测、肿瘤分子病理检测等服务。 如需了解更多有关高通量测序相关信息,欢迎拨打华银高通量全国服务热线:400-100-8786 |
|