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清朝与准噶尔战役（人口损失60余万） 准噶尔汗国系卫拉特蒙古准噶尔部所建的汗国，在噶尔丹、策妄阿拉布坦、噶尔丹策零时期达到汗国巅峰，统治人口达500余万。 清朝与准噶尔之争前后延续达70余年，著名的战役包括乌兰布通之战、昭莫多之战、和通泊之战、光显寺之战等，最后因内讧、瘟疫等原因不敌清军，清军攻占准噶尔汗国后大开杀戒，准噶尔部大部分屠灭，经此役蒙古族人口损失达60余万，并彻底改变了天山南北的人口结构。 年羹尧与罗卜藏丹津之战（清朝与和硕特汗国）（人口损失15万-20万） 和硕特汗国系卫拉特蒙古和硕特部首领，成吉思汗之弟哈萨尔后裔固始汗所创立，统辖青藏地区，雄兵20万。固始汗去世后准格尔汗国进攻拉萨，清朝与和硕特部联合击溃准噶尔汗国，后清朝欲加强的和硕特汗国的控制，并实施分化之策，和硕特汗国罗卜藏丹津清兵反清， 年羹尧帅清兵镇压，并对青海地区的蒙古族进行无差别的歼灭，数十万蒙古族部众仅剩数万人，清朝又将他们划分29旗管理，实行“扶番抑蒙”（压制蒙古族，扶持藏民）政策，又要求凡内陆官员来青海，不管其官阶高低，青海诸王公须跪拜迎接。在这种政策下，到新中国成立初进行人口统计时青海蒙古族仅剩2万余人。  明朝与云南梁王之战（人口损失10万—20万） 1368年，元朝主力已退居漠北，元梁王占据云贵一代，统领20万雄兵，坚持与明朝对抗。1381年朱元璋攻伐云南梁王，梁王不敌自缢殉国。明军攻占云南后对蒙古族部众及其盟友进行了大规模清剿战，著名航海家郑和时年仅为11岁，却惨遭阉割，成了朱棣的家奴，可见当时景况之惨烈。战后明朝从内陆大规模迁民之云南。  清朝与布尔尼 布尔尼是察哈尔部首领，林丹汗之孙，林丹汗败北清朝后，布尔尼被封为察哈尔亲王，其父则被囚禁于盛京。因此布尔尼趁“三藩之乱”（吴三桂、尚可喜、耿金忠反清）起兵反清，被其妃子长史辛柱公主所发觉后向清廷告密，布尔尼遭到失败。此役后，作为蒙古族的中枢力量的察哈尔部遭到种种苛刻的待遇，不仅成吉思汗汗位传承从此复存在，部众亦成为“满洲家奴”和兵丁来源，从盛极一时到逐渐衰落。  土尔扈特人东归（人口损失17万） 16世纪，游牧于伏尔加河一代的蒙古族土尔扈特部与日渐强大的俄罗斯帝国间的矛盾日趋加剧，在宗教、习俗冲突，生存空间收缩等因素下，土尔扈特部首领渥巴锡闻讯清朝歼灭准噶尔部，天山南北已成人烟的消息，决定率部范围卫拉特故土，史称“土尔扈特人东归”，即著名的“东归英雄传”。 渥巴锡率部启程时，因伏尔加河未结冰，河西的部众未能随行，成为今天俄罗斯境内的卡尔梅克共和国，河东部众24万余人，后有俄罗斯追兵，前有哈萨卡人堵截，并随时有可能遭到清朝攻击的艰难条件下，到达伊利时竟不足7万人，后又遭受清廷各种打压，人口进一步缩减。 金丹道事件（人口损失预计10万） 发生在清末的金丹道事件，预计蒙古族人口损失达10万余人，同时清廷镇压导致金丹道方面人口损失亦非常严重。  捕鱼儿海之战（人口损失20万） 洪武二十年（1387）9月，明太祖遣永昌侯 蓝玉 为大将军率军进攻 北元 。次年四月，兵至庆州（今内蒙古巴林右旗西北），闻元主脱木思帖木儿在捕鱼儿海，遂掩旗息鼓，兼程而进，元军无所觉察。大军到后，元太尉蛮子仓促拒战，被杀。脱木思帖木儿与太子天保奴等数十骑遁去。明军获其次子地保奴及故太子必里秃妃并公主等一百二十余人，官属三千，军士七万，马牛驼羊十五万及宝玺、 图书 、金银印等， 捕鱼儿海战役是北元贵族遭到的最大的失败，自脱古思帖木儿死，蒙古内部就开始陷入了连绵不断的内讧之中，其间虽然有过几次统一，但对明朝始终未能构成倾覆性威胁，后元时代彻底结束。由于大量牲畜被明军带走，蒙古部民饿死冻死无数。  |
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