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TCGA是什么，这里就不介绍了，大家自行检索吧。它的数据下载分为两种：1.网页下载（数据量大时不稳定），2.命令行下载（方便大数据下载）。现在要讲的就是命令行下载。 1.打开TCGA主页，点开Launch Data Portal 2.1.选GDC Apps---Data Transfer Tool---下载后解压，存到你想存的文件夹里 2.2解压后文件名叫gdc client.exe 3.1.点data，进去页面，点左边的case，选择pancreas（学习的例子是以胰腺癌为例） 3.2 点case旁边的file，然后勾选选项。我就不说为什么选这些选项了，这些都是根据自己的需要来选，现在勾选的这些是用来举例子的。选完之后点中间蓝绿色的键，Add all files to the cart，于是cart（购物车）里就有182个文件了。
3.3点右上角的cart进入这个页面，点download，就会出来manifest和cart。点击manifest，直接下载，与gdc client.exe放在同一目录下面。 4.两种方法：1，点“开始”，在对话框输入cmd，2.或者按windows键+R。进入DOS。 5.1.将存有gdc client.exe和manifest文件文档的地址复制，先输入cd，再把地址粘贴进入DOS对话框。如果不是C盘，记得先写D：或者E：回车，再输入cd，粘贴地址。5.2刚才说我C盘里的gdc client.exe是木马，不让我运行，我换D盘试试，也不行，最后发现是安了三六零，把它卸载之后应该可以了。现在gdc client.exe和manifest文件是存在D盘一个叫gdc的文件夹里。 命令是这样的 D:\gdc>gdc-client.exe download -m gdc_manifest_20161213_015958.txt然后点回车，注意gdc client一定要有后缀名exe，manifest文件一定要有后缀名txt。可以复制文件名后按Tab键，后缀就出来了。 简单来说就是D:\gdc>加gdc client文件名+gdc client后缀+download+空格+-m+manifest文件名+manifest文件的后缀+回车 然后就下载好了，所有的文件会在D盘的gdc里。 |
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