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这位发5分SCI的大哥,我是不是对你的机制验证有些误会?

 小梦想在努力 2019-10-05

跟随着信号通路,夏老师会带你们看看对应的信号通路相关的蚊帐。原本想着带你们也别看太复杂的,就选五分吧,谁知道又是直接对这篇蚊帐公开处刑……

这篇蚊帐发在Plos Genetics(IF=5.224)上,但这篇蚊帐却只是一篇移植性研究,差不多意思就是把别人研究得差不多的,再在他们自己的疾病模型里再研究一遍。

为什么这么说呢?如果有印象的老粉丝,可能知道,夏老师在2015年的时候,讲过一篇NKILA这个lncRNA的文献,那篇应该是发在Cancer Cell上的,讲的是NKILA作为一个LncRNA遮蔽掉了IκB的磷酸化位点,抑制IκB磷酸化,从而抑制NF-κB信号通路的过程。这篇文章真的是没什么尿点,确实很有意思……

但今天的这篇,基本上就是重复讲了一下NKILA对NF-κB信号通路的抑制作用,就没啥然后了。而且,双鸭山大学的老板,可能对机制研究有些误解……

首先他们做的就是常规的表达差异分析,发现NKILA在肿瘤患者中低表达:

接着,还是表达验证……对于不同的肿瘤分期的原位表达验证:

接着,还是表达验证,这次验证了一下生存曲线……一下子3个Figure,就表达了差不多一个意思,也就是:这个LncRNA在肿瘤中低表达。

接着就是表型实验,这实际上做得也并不太突出,也就是过表达NKILA(毕竟肿瘤中低表达嘛,表型就要过表达才能体现)对常规的细胞凋亡、裸鼠成瘤、克隆形成等等,进行验证:

然后还是表型验证……当然,这里他们做了点回复实验,先筛选出高表达NKILA和低表达NKILA的细胞株,对他们分别进行敲减和过表达,来验证表型。实际上,做到这里,仍然还是三分的东西,没什么创新的东西在里面:

接下去,理应是5分文章比较重要的环节,机制验证。如果对于夏老师之前讲的NF-κB信号通路还有那么点印象的话,应该还记得整个过程,就是IKK磷酸化后激活了IκB的磷酸化,使之降解,释放出NF-κB,激活通路。

常规来说首先是要先激活NF-κB信号通路(用TNF激活)然后过表达NKILA后,验证NF-κB信号通路的活性,差不多这样:

一般会分析P65和P50的入核,用Luciferase来分析NF-κB下游基因的激活等等。这篇蚊帐也是这么做的,正因为NKILA抑制了NF-κB信号通路,所以过表达和敲减的验证都是很顺利的。

但是……双鸭山的大哥们……你们接着做的事情,我就觉得有点匪夷所思了……因为他们使用了NF-κB抑制剂?

原文表示是为了表明NKILA是通过抑制NF-κB来起到作用的,所以用了俩NF-κB的入核抑制剂:

虽然听上去还不错,通过阻断掉NF-κB信号通路,然后证明NKILA只能通过NF-κB信号通路起到作用,过表达后,NKILA无法通过其他信号通路来产生影响。

但是大哥,你们是在上游通过NKILA抑制NF-κB从IκB上解离后,再用了NF-κB的入核抑制剂……这能证明啥啊?在这里不是应该先敲减后,促进了NF-κB信号通路,然后再用NF-κB入核抑制剂来验证么?方向都搞反了……这招总结成成语是不是应该叫“雪上加霜”啊……

总的来说,这篇蚊帐基本上没什么新意,在信号通路方面,也只能给你们作为一个反例,唯一还值得看一下的是,他们研究NF-κB信号通路的常用工具,都给你们展示了一遍。也希望大家不要开始膨胀地表示:卧槽,我也能发这样的蚊帐啊!别瞎想了,毕竟人家也是有一定的工作量的,好吧,想要看这篇蚊帐的话,就自己去搜搜吧,要么就回复“公克”(不要在评论区回复),或者直接星球上见(当然,进不去也无所谓)。好了,今天就先策到这里吧,祝你们心明眼亮。   

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