根据转录因子预测靶基因

一般来说转录因子预测靶基因有4个步骤：

以上 4个步骤为无参物种预测靶基因的方法，如果是数据库中有收录的物种，可以直接根据TF的ID号进行search找到TF的靶基因哦~

接下来，楼主以植物无参物种为例，一步一步跟大家讲解怎么找靶基因……

1. 打开网页，找到标签”Blast”

TF数据库：http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/

如果是有参物种，第一步去blast后可以直接跳转到ID号……

2. 点击“Blast”，并在序列输入框内，粘贴进去目标TF的蛋白序列，点击下方“Blast”搜索框进行搜索：

3. 进入搜索结果页面，显示比对结果，将其往下拖动，看到比对上的参数指标表格如下：

4. 选择比对效果最好的（第一个），点击进入。得到如下细节结果：

5. 找到上述红框中best hit 对应的ID，即最初输入的序列比对到拟南芥中的基因ID，点击进入，你将得到这个界面：

6. 点击红框中名称，进入有相互作用的基因的的界面：

7. 如下红框框出的内容为与目标TF相互作用的基因：

8. 点击互作基因名称右侧“Links 'A'”一栏的ID，获得对应基因信息，包括ID号以及注释信息，即为预测的与目标基因相互作用的基因。

Done!