外泌体中LncRNA研究思路解析及资源！！

 如果你正在开展非编码rna与外泌体方面的研究，或者将要开展，那么希望本文能够对你有所帮助哦~附件为大家提供了lncrna相关资源。
一、背景介绍
1）外泌体形成的过程：
a、早期核内体成熟为晚期核内体，其中多个腔内小泡(ilvs)是由内体膜向内出芽产生的。ilvs的积累导致多泡体(mvbs)的形成。
b、供体细胞产生的蛋白质和核酸在mvb形成过程中可进入小泡内。c、外泌体通过mvb与细胞膜融合释放到细胞外环境。外泌体通过三种途径被受体细胞吸收:直接融合、受体介导的融合或内吞作用。


➤  如下图所示：
a. lncrna通过海绵吸附mirna调控靶基因的表达
b. lncrna可以与mrna相互作用调控靶基因的表达
c. lncrna作为不同蛋白的支架，形成核糖核蛋白(rnp)复合物，调控基因表达
d. lncrna引导表观遗传修饰物改变染色质结构、组蛋白甲基化/乙酰化水平以及dna甲基化水平
e. lncrna与转录复合体相互作用，作为诱导物促进或抑制基因转录
f. lncrna还具有促进或抑制基因转录的功能



二、文献解析
1）机制图展示一




2）反义转录


3）思路解析

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4）结果展示


























5）机制图展示二




6）思路解析




7）结果展示

























三、总结借鉴

1）如何确定一段序列是否为incrna
➤  5’race和3’race得到全长
➤  northern blotting检测
➤  orf finder预测
➤  coding potential calculator (cpc)/ coding potential assessment tool (cpat) 预测其编码蛋白的能力
➤  fish检测在细胞中的定位

2）fish检测在细胞中的定位
➤  blast得到lncrna与靶基因的高度互补区域
➤  rna pull-down/rip检测lncrna是否靶基因mrna互作
➤  pcr检测lncrna与靶基因mrna是否形成双链
➤  α-amaniti处理