化合物和药物的研究指南：Drugbank数据库

DrugBank数据库是由加拿大卫生研究院（Canadian Institutes of Health Research）、阿尔伯塔大学和代谢组学创新中心（The Metabolomics Innovation Centre，TMIC）资助的综合型免费药物和药物靶标数据库。虽然是免费的，但是也有付费服务，适用于药企研发平台等。

DrugBank综合了药物（即化学、药理学和药学）数据与综合药物靶标（即序列、结构和途径）信息。目前最新版是5.1.4，于2019年7月2日更新，包含13,339个化合物，其中小分子化合物2,596个，蛋白多肽药物1,289个，保健品130个，实验药物6,304 个，以及与药物相关的5,188个蛋白（如药物靶点、酶、转运蛋白）序列。数据涵盖范围以美国、加拿大和欧洲为主。数据库内容可以下载到本地。（高级检索需要注册Advanced Search）

根据药物名称检索

在这里我们以热门明星单抗 “keytruda”来看一下都能检索到哪些内容：（通用商品名可搜索，结果会显示为小分子化合物名称或抗体名称）

一、简介

包括药品名、结构式、商品名、剂型、规格、上市公司、cas号，分子量，IUPAC 名等信息。均有外链到其他数据库。

二、药理学

包括适应症、作用机制、毒理等信息。

三、相互作用

与其他药物、食物的相互作用信息。这部分可以给做药物相互作用毒理药理的同学参考。

四、参考文献

文献，其他数据库等，也可以下载FDA的说明书以及化学安全技术说明书。

五、临床试验

包括临床阶段，临床状态等信息。但是这个并没有链接到NIH的数据库。只能自己再去临床试验数据库查询。

六、药物经济

包括剂型、剂量、给药方式及相关专利信息。

七、药物理化性质

八、靶点

包括药物作用的靶点，有的药物可能有多个靶点，而且可以查看靶点的详细信息。

有的化合物是有质谱数据的。可供研究者参考。

根据靶点检索

这一项比较实用了，根据我们现在研究的靶点，可以立即了解到目前上市药物、具有市场潜力的待开发的药物信息。

PD-1靶点“programmed cell death protein 1”为例进行检索。（不要输入缩写，搜索引擎貌似不支持缩写搜索）

检索结果如下：靶点简述以及与靶点相关的药物。

可以通过药物最后一行的“Details”查看药物具体信息。

这一项搜索适用于根据靶点进行药物设计的同学。会显示已经批准的药物和在申报或在研的化合物。

根据信号通路检索

检索一个glucose相关的pathway

Pathway链接到的是http:// （有兴趣可以下次介绍）。

这是glucose-alanine cycle

信号途径检索没有KEGG pathway那么全面。

右侧界面可以把这个信号通路图变成你想要的样子。改颜色，改元件等等。

其他检索

Drugbank数据库可以对药物进行筛选查看，点击“Browse”。

其中可以通过药品名，药物分类，作用途径，药物作用，药物分类，药物靶点等进行筛选查看。

分类中可以选择是小分子药物（Small Molecule Drugs）还是生物药(Biotech Drugs)，筛选项包括是否批准（Approved）,是否保健品（Nutraceutical），是否违禁药（Illicit），研究药物（Investigational），撤回药物（Withdrawm）,实验药物（experimental）。

还可以选择属于美国、加拿大、欧洲的市场。

在Drugbank主页面上部还有“search”选项，包括结构式，分子量，靶点序列等检索方式。

以结构式检索为例，在左侧可以画结构式，右侧可以设置检索相似值等，对结构式进行模糊检索，可以找到与目标结构式相近的药物。感觉这个功能对药化的同学比较友好。可以看看合成的化合物结构类似化合物的靶点作为参考。

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夏季霸老师：DrugBank实际上是个很有用的数据库，特别是对于中药和化合物研究，有很多可以借助DrugBank的地方。有兴趣的可以自己试试看，自己百度一下咯……感谢乔思邈给我们的这次分享，谢谢啦！好啦，今天就先策到这吧，祝你们心明眼亮。