将肿瘤体细胞上的拷贝数变化,somatic copy-number alterations, 简称为SCNAs。通过
红色代表染色体片段的扩增,绿色代表染色体片段的缺失。在网站上,可以通过以下两种方式来查看结果
以第二种方式为例,首先选择数据分析的版本和感兴趣的肿瘤类型 结果分为了3个部分 1. summary对肿瘤数据集包含的样本个数和分析结果进行了简单描述,示意如下 同时还给出了分析过程的简要描述和软件对应的参数,示意如下 2. Amplifications扩增的结果示意如下 3. Deletions缺失的结果示意如下 扩增和缺失的结果展示形式时一样的,每一行代表一个拷贝数变异的染色质片段,点击每行的任意区域,可以查看该区域包含的靶基因。 通过这个数据库,可以查看TCGA中各种肿瘤的拷贝数变异分析结果。 ·end· |
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