DENdb采用5种不同的方法对人类不同细胞系中的增强子进行了预测,同时还提供了增强子区域与DNA内切酶超敏位点,转录因子结合区域的overlap信息,该数据库网址如下
采用的5种方法列表如下
该数据库中不同细胞系预测到的增强子数量汇总如下 每种方法对应的增强子数量统计如下 目前该数据库的检索功能已经失效了,只能从下载的文件中查看增强子的相关信息,从下载的 从下载的 从下载的 类似的从下载文件也可以得到TFBS以及增强子与TFBS的交集信息,同时还提供了增强子靶基因信息,根据 该数据库中的增强子区间信息是基于hg19版的基因组来定位的, 其预测增强子区间的方法值得借鉴。 ·end· |
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