【原】LincSNP:lncRNA相关SNP位点数据库

lncRNA在疾病的发生与发展中发挥着重要作用，但是具体的角色是什么，就需要深入挖掘和探究。

在过去通过GWAS分析鉴定出了非常多的与疾病相关的SNP位点，最直接简单的分析当然是首选那些位于蛋白编码基因上的SNP位点，就像蛋白编码基因只占了基因总数的很小一部分一样，位于蛋白编码基因上的SNP位点也只占了所有SNP位点中很小一部分比例。

在剩余大部分SNP位点中，有一类位点引起了科学家的关注，那就是位于lncRNA相关的SNP位点。通过探究这些位于lncRNA基因上的SNP位点，为我们研究lncRNA在疾病中的角色和作用提供了打开了一个新的视角。

lncRNA相关的SNP位点包括以下两类

1. 位于lncRNA基因区域的SNP位点

2. 位于lncRNA基因转录因子结合区域的SNP位点

无论是直接位于lncRNA的基因上，还是位于调控该基因的转录因子结合位点，SNP位点的存在都对lncRNA的转录造成了一定的影响，通过SNP-lncRNA-disease的策略，来筛选相关的SNP位点来重点研究，基于这个思路，有很多已经发表的文献，有科研工作者收集整理这类文献，并将其中的信息做成了数据库，就是LincSNP,网址如下

http://210.46.80.146/lincsnp/index.html

目前版本为2.0，通过Linc-confirm菜单，可以发现文献中发表的与疾病相关的lncRNA SNP位点，示意如下

通过Linc-Score功能，可以检索特定lncRNA基因相关的疾病，示意如下

该数据库是免费下载，示意如下

该数据库以SNP位点为桥梁，建立起了lncRNA与疾病之间的关联，这个思路值得借鉴。

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