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大家好，我是ANGUS，近期有部分数据库使用者反映数据库安装报错，主要是以下情况。 导致该报错的原因主要是mimiciii schema未建立，现MIMIC官网也已同步更新纠正了该错误。 知道了问题的原因，那么解决的办法就是在mimic库下建立mimiciii schema即可。 代码如下： CREATE SCHEMA mimiciii; 那么基于之前的设置： ⑴26个CSV文件所在目录：E:TEMP ⑵4个SQL批处理文件所在目录： E:PostgreSQL_s 那么我们完整的建库代码如下： DROP DATABASE IF EXISTS mimic; CREATE DATABASE mimic OWNER postgres; c mimic; CREATE SCHEMA mimiciii; setsearch_path to mimiciii; i E:/PostgreSQL_s/postgres_create_tables.sql setON_ERROR_STOP 1 set mimic_data_dir 'E:/TEMP' i E:/PostgreSQL_s/postgres_load_data.sql i E:/PostgreSQL_s/postgres_add_indexes.sql i E:/PostgreSQL_s/postgres_checks.sql 这里再交代一下本人在医学方公众号群中解答的问题原则： ⑴严格按照公众号执行代码出现问题的欢迎咨询。代码执行是一个很细致的过程，有的时候落了一个字母，或少了一个引号都会导致报错，欢迎各位偷懒直接复制公众号的代码以避免不必要的麻烦。咨询时请将整个报错窗口截下来发至群里。 ⑵自行改sql文件代码报错的不要来找我； ⑶电脑兼容报错的，如开启软件后系统提示兼容性错误的，请自行查找报错原因，排查冲突进程； ⑷有问题请多在公众号群里问，请千万千万不要来加我微信，微信是作者的私人生活圈，如非必要请不要来骚扰了，谢谢谅解。 谢谢大家对医学方及mimic数据库的关注和支持，接下来我们继续正题。 在上一个专题我们了解了有关病人人口学信息及院内周转信息的6张大表，今天我们要继续了解在监护室住院期间我们所采集的各类信息。 今天主要介绍以下8张表格： CAREGIVERS CHARTEVENTS DATETIMEEVENTS INPUTEVENTS_CV INPUTEVENTS_MV NOTEEVENTS OUTPUTEVENTS PROCEDUREEVENTS_MV 1 CAREGIVERS——护理人员信息 该表格包括以下信息（与前一专题重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 CGID：护理人员标志符，类似于单位里的员工码一样的存在 LABEL：主要为头衔缩写，如MD表示医学博士，RN表示注册护士等 DEION：对LABEL的进一步解释，说明该护理人员的类别
2 CHARTEVENTS——病人观察记录数据 该表格包括以下信息（与前面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 ITEMID：项目标志符 CHARTTIME：记录时间 STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 VALUE：ITEMID对应项目值 VALUENUM： 如果VALUE值是数值型，则显示为VALUE相同的值； 如果VALUE值不是数值型，则显示NULL； 如果VALUE的ITEMID对应于评分项目，则VALUE包含项目名称及分值，而VALUENUM只包含分值 VALUEUOM：VALUE值如有单位，则显示其单位，否则为NULL WARNING：Metavision数据系统专有。提示是否数值触发了警报 ERROR：Metavision数据系统专有。提示测量记录过程是否发生错误 RESULTSTATUS：CareVue数据系统专有。表示测量记录类型，有以下2种 Manual表示手动 Automatic表示自动 STOPPED：CareVue数据系统专有。表示测量记录是否被终止
3 DATETIMEEVENTS——病人操作相关日期时间信息 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 ITEMID：项目标志符 CHARTTIME：记录时间 STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 VALUE：ITEMID对应项目日期时间数据 VALUEUOM：VALUE值类型，主要有2种类型 Date表示日期 Date and Time表示日期+时间 WARNING：Metavision数据系统专有。提示是否数值为警报值 ERROR：Metavision数据系统专有。提示测量记录过程是否发生错误 RESULTSTATUS：CareVue数据系统专有。表示测量记录类型 STOPPED：CareVue数据系统专有。表示测量记录是否被终止
4 INPUTEVENTS_CV——Philips CareVue系统入量数据 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 CHARTTIME：记录时间 ITEMID：项目标志符，CareVue常用药物的ITEMID在30000-39999之间，而出入量项目的ITEMID在40000-49999之间 AMOUNT：前次记录时间至现在的总入量，大多是按每小时计 AMOUNTUOM：入量单位 RATE：入量速率，如无则显示NULL RATEUOM：速率单位，RATE为NULL时，该项也为NULL STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 LINKORDERID：药品组合标志符 ORDERID：官网的说法是药品组合标志符，但与LINKORDERID又有所不同，它是LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符，每个ORDERID对应一个给药速率，每次给药速率改变时即产生一个新的ORDERID，可用于追踪给药速率，所以将它理解为药品组合给药速率标志符会更好理解 STOPPED：输液是否中断或续药等 NEWBOTTLE：新液体准备状态。1表示已准备新液体已化好就绪，NULL表示无 ORIGINALAMOUNT：药品组合最初总量 ORIGINALAMOUNTUOM：药品组合总量的单位 ORIGINALROUTE：最初给药途径，如经口、静脉等 ORIGINALRATE：最初给药速率 ORIGINALRATEUOM：最初给药速率单位 ORIGINALSITE：最初人体给药部位，如左手、左脚等
5 INPUTEVENTS_MV—iMDSoft Metavision系统入量数据 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 STARTTIME：出入量活动开始时间 ENDTIME：出入量活动结束时间 ITEMID：项目标志符，Metavision的ITEMID均大于220000 AMOUNT：从STARTTIME至ENDTIME的总入量 AMOUNTUOM：入量单位 RATE：入量速率，如无则显示NULL RATEUOM：速率单位，RATE为NULL时，该项也为NULL STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 LINKORDERID：药品组合标志符 ORDERID：LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符 ORDERCATEGORYNAME：所给药品一级分类目录名 SECONDARYORDERCATEGORYNAME：所给药品次级分类目录名 ORDERCOMPONENTTYPEDEION：药品在药品组合中的作用 ORDERCATEGORYDEION：所给药品类型，针剂、非针剂等等 PATIENTWEIGHT：患者体重，以千克计 TOTALAMOUNT：输注液体最初体积总量 TOTALAMOUNTUOM：输注液体体积单位 ISOPENBAG：表示装有溶液的输液袋是否已打开 0表示未打开 1表示已打开 CONTINUEINNEXTDEPT：出科后是否续药。这项仅出科时有意义。 0表示出科至新科室后不续药 1则表示续药 CANCELREASON：医嘱取消原因 STATUSDEION：输液状态，主要有以下几种： Stopped表示停止液体输注或液体输注结束 FinishRunning表示液体已输注结束 Rewritten表示对液体输注记录进行修正 Changed表示对输液参数进行改动 Flushed表示一条液体通路已被冲管 COMMENTS_EDITEDBY：输液医嘱修改标记，显示为操作者头衔 COMMENTS_CANCELEDBY：输液医嘱取消标记，显示为操作者头衔 COMMENTS_DATE：COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY发生的时间 ORIGINALAMOUNT：记录时输液袋内剩余液体量 ORIGINALRATE：最初输液速率
6 NOTEEVENTS——病人医疗文书资料 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 CHARTTIME：记录时间 CATEGORY：文书类别，包括出院录，ECG报告，心超报告balabala… DEION：对CATEGORY的进一步解释，比如radiology类别下的MRATHORACICSPINE检查报告 CGID：文书录入医护人员 ISERROR：错误提醒。当显示为1时，表示此处被标记为此处医师认为存在错误，否则显示为NULL TEXT：文书具体内容
7 OUTPUTEVENTS——病人出量信息 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 CHARTTIME：记录时间 ITEMID：项目标志符 VALUE：自上次记录时间到现在液体出量 VALUEUOM：出量单位 STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 STOPPED：输液是否中断 NEWBOTTLE：新液体准备状态 ISERROR：错误提醒。
8 PROCEDUREEVENTS_MV—Metavision系统的操作信息 该表格包括以下信息（与上面重复的部分，我就介绍地简略一些） ROW_ID：行号 SUBJECT_ID：住院号 HADM_ID：病案号 ICUSTAY_ID：ICU病案号 STARTTIME：操作或手术开始时间 ENDTIME：操作或手术结束时间 ITEMID：项目标志符 VALUE：ITEMID对应项目值 VALUEUOM：VALUE值如有单位，则显示其单位，否则为NULL LOCATION：通路部位，如无则显示为NULL LOCATIONCATEGORY：LOCATION所属目录 STORETIME：录入数据上传至信息系统及确认时间 CGID：护理人员标志符 LINKORDERID：药品组合标志符 ORDERID：LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符 ORDERCATEGORYNAME：所给药品一级分类目录名 SECONDARYORDERCATEGORYNAME：所给药品次级分类目录名 ORDERCATEGORYDEION：所给药品类型 ISOPENBAG：表示输液袋是否已打开 CONTINUEINNEXTDEPT：出科后是否续药。 CANCELREASON：医嘱取消原因 STATUSDEION：医嘱状态 COMMENTS_EDITEDBY：操作或手术修改标记，显示为操作者头衔 COMMENTS_CANCELEDBY：操作或手术取消标记，显示为操作者头衔 COMMENTS_DATE：COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY发生的时间
那么到这里，第2部分的8张大表我们就介绍完了，下一期我们将继续学习剩下的大表。 我是ANGUS，我们下一期再见。 “医学方”始终致力于服务“医学人”，将最前沿、最有价值的临床、科研原创文章推送给各位临床医师、科研人员 |
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