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生信练习题:如何根据FASTA的ID拆分数据

2020-03-31  生物_医药...

给定一个FASTA文件,他以多行形式存放数据,如下所示

请根据每个序列的ID中的染色体编号拆分数据,例如上面两个数据,需要新建两个文件,分别是chr7和chr8,将这两条序列分别输出到这两个文件中。

不限制语言,测试数据可以从网盘中下载。

链接:https://share.weiyun.com/5ecURT0 密码:pzsiab

我调用kseq.h文件,编写了一个程序,代码如下

运行速度如下

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