一、人体是“微生物”组合而成的“生物大厦”
我们从出生、幼年、少年到成年，无时无刻都和微生物密切相关。从出生开始，微生物开始在我们人体肠道里定植，到我们日常接触的食物、空气都存在大量微生物，我们的皮肤、口腔、肠道诸多部位都存在大量的微生物，可以说，人体就是一个由微生物组合而成的“生物大厦”！
总体来说，人身上的微生物大约有1.5公斤，其中鼻腔内微生物有10克，口腔内有20克，肺部有20克，胃肠道有1000克，皮肤有200克，生殖道内有20克，绝大部分人体微生物分布在胃肠道，约占人体微生物总重量的80%以上。
近年来，随着人体微生物研究的不断深入，人们发现，肠道微生物与人体多种疾病息息相关，不仅包括消化道类疾病如结肠炎、结肠癌（这些消化道疾病，菌群和消化道是直接接触的），还包括代谢类疾病如肥胖和II型糖尿病，免疫性疾病如类风湿关节炎，精神疾病如抑郁症、焦虑症等，都是和肠道菌群关系密切。
接下来我给大家介绍一下我们做肠道菌群疾病诊断标志物的一些经典研究。
在中国人群体中找到了20个能区分大肠癌和健康对照的微生物基因标记物，验证集显示其中4个基因标记物在丹麦人群中发挥作用。在法国人群和奥地利人群中，这4个基因标记分别在AUC
=0.72及0.77下能区分大肠癌患者和健康人。
在中国人群体中对其中2个基因标记物进行qPCR检测，能准确区分大肠癌患者和健康人（AUC=0.84)，这些基因标记物在大肠癌的早期阶段（I-II）富集，可以作为大肠癌早期诊断的生物标记物。
通过这一些列研究表明，通过肠道微生物进行一些疾病监测是可能的。
二、目前各国的微生物相关研究计划
目前国际上与微生物相关的重大研究计划非常多。
美国早在奥巴马政府时期，就宣布美国国家微生物组计划启动。
我们做了一个调研，我们发现美国微生物组计划的启动将会给以下五大行业迎来新一轮变革。
首先是医疗健康行业，因为原先不知道这些疾病与菌群是相关的，现在大量研究发现炎症性肠病、大肠癌、II型糖尿病、肥胖、肝硬化、冠心病、动脉粥样硬化、风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、抑郁症、自闭症等众多慢性病与人体微生物组密切相关。一大批微生物（态）药品将上市，取代现有的化学药品（西药），特别是取代医院现在广泛应用的抗生素类药品！
第二个领域是体外诊断行业，根据人体微生物组设计的各种疾病高相关性分子标记物，可以用来进行慢性疾病的早期检测包括早期发现、早期预防和早期干预。
第三个领域是健康管理行业，人体微生物组菌群成分的变化，可以在人体内环境层面反映人体健康特征，菌群就像人体健康的“晴雨表”。可以实时地对人体的健康进行监控。
第四个行业可能就是保健品行业，因为之前我们太多保健品的效果和作用说不清道不明，我们认为这个也和第三个健康管理行业是息息相关的，因为有了对人们健康监控的手段，验证这些保健品是否真的管用就有了一套方法，所以我们认为这套方法可以促进保健品调理评价体系的形成。
最后一个是我们传统中医药行业，基于微生物组大数据的疗效评价体系，可以促进中医药治疗效果的标准化，这个也是我们之前遇到的最大的问题，所以说也是有利于我们中医药事业走向世界、走向国际市场。
这些行业都是随着微生物组计划的深入，在未来十年很有可能逐步展开、创造出各种创新创业机会的行业。有些行业，在美国欧洲现在已有很多创业型公司已经开始如火如荼地开展了，有产品、有市场、有融资、有上市，这一块在第二部分我会详细介绍。
国外微生物组计划发展非常火热，国内相对的来说资助力度还不像国外那么大，不过国内科学家和相关部委也正在酝酿和发布微生物组相关研究计划。
随着二代测序技术在疾病领域研究的发展，以微生物菌群为靶点的治疗方案是精准医疗一个重要体现。
生命科学和医学目前都进入了大数据的时代，大量的生物信息数据、临床数据为精准医疗的深入发展提供了重要基础。
三、国际微生物相关产业发展状况
目前，在国外人体微生物组相关产品已经在临床上应用！有的被美国FDA批准！有的公司已经IPO上市了！
我国正在筹建的山东基因科学研究院，它位于济南高新区，是山东省大力发展生物医药产业而成立的专业化园区，致力于打造国内一流、世界知名的“济南药谷”。我们成立这个研究院的目的是将最前沿的基因组学科研成果应用于疾病诊断、健康管理及精准医学等领域，推动基因科技成果转化。
1、群友：国内有些公司已经将肠道微生物用于消费者健康评估，请问目前是否靠谱？
作者：其他的公司我不知道，起码美国已经在做这件事情了。需要看具体和疾病关联程度的强弱，数据量积累比较有限。另外菌群受饮食、年龄、地域影响特别大，所以国内现在的主要集中北京、上海、广州、深圳的城市，西部以及偏远山区实际上数据还是空缺，数据更加完善之后，结果才能更有说服力。
2、群友：微生物的基因标志物可以做早期诊断吗？是因为收取标本的过程中就考虑到早期或者晚期分期的差别吗？
作者：我觉得这个问题是非常好的，因为这个和我们在浙大附属医院做的肝硬化是非常相近的，当时我们第一篇文章主要是做了一些住院的肝硬化。最终的目的是做早期的诊断，因为到后期并发症都有了之后再做这种诊断就没有意义了。当时我们研究还有一些缺陷，所以和美国的教授进行了一些争论。当时晚期的样本是偏多的，早期的样本偏少，所以我们现在还进行一些后续的研究，大量地收集的早期的肝硬化进行菌群的分析，看看标记物和晚期是否一样，究竟哪些可以作为疾病的早期诊断。我觉得这个不是很轻松的目标，所以也需要全国做肝病的专家一起努力，才能达到做早期诊断的目标。
3、群友：有人说人类机体的微生物群或许是一个原始的天然药厂，您怎么理解这句话？
作者：我觉得这是一个很好的idea，因为我们的肠道菌群中，据研究，一个正常人有上千种的微生物，这些微生物可以产生各种各样的代谢产物作为药物，只不过之前做研究比较少，大家可能做一些天然的微生物，比如海洋海底做的一些天然产物比较多，肠道研究相关的偏少，所以我对这个领域比较看好，今后随着肠道菌群研究越来越多，越来越多的合成生物学家或者是药学家应该可以从肠道菌群中找到新的灵感。
4、群友：您觉得国内微生物组研究到患者疾病预测需要多长时间？目前标本是如何收集的？
作者：我认为时间不用很长，可能在两三年，甚至是一两年我觉得就可以了。
