48个实用的生信在线工具

在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。

基因结构绘制

1.Exon-Intron Graphic Maker
工具链接：
ttp://www.wormweb.org/exonintron

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RNA二级结构

2.Mfold
工具链接：
http://unafold.rna./?q=mfold

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3.RNAfold
工具链接：
http://rna.tbi./cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

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蛋白互作网络

4.String
工具链接：
https:///

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基因共表达网络

5.Coexpedia:
工具链接：
http：//www.coexpedia.org/

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序列Motif

6.MEME
工具链接：
http:///

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7.Weblogo
工具链接：
http://weblogo./

image.png

基因信息查找

8.Genecard
工具链接：
http://www.genecards.or

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序列展示

9.ESPript:
工具链接：
http://espript./ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi

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Gene ID转化

10.BioMart
工具链接：
http://www./index.html

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11.g:profiler
工具链接：
https://biit.cs./gprofiler/convert

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12.UniPort Retrieve/ID mapping
工具链接：
https://www./uploadlists/

image.png

13.bioDBnet
工具链接：
https://biodbnet-abcc./

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韦恩图

14.Venny2.0
工具链接：
http://bioinfogp.cnb./tools/venny/index.html

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15.OmicShare 韦恩图工具
工具链接：
http://www./tools/Home/Soft/venn

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三元图

16.Ternary plot maker
工具链接：
https://www./

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基因结构分析

17.FGENES
工具链接：
http:///

image.png

范例结果：

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系统发育分析

18.iTOL
工具链接：
https://itol./

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19.Evolview
工具链接：
http://www./evolview/

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启动子预测

20.Promoter Scan
工具链接：
http://www.cbs./services/Promoter/

image.png

蛋白一级结构预测

21.PredictProte
工具链接：
https://www./home

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22.ProtParam tool
工具链接：
http://web./protparam/

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信号肽预测

23.SignalP
工具链接：
http://www.cbs./services/SignalP/

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跨膜结构域

24.TMHMM Server v. 2.0
工具链接：
http://www.cbs./services/TMHMM/

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亚细胞定位

25.PSORT
工具链接：
https://www./

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蛋白三级结构预测

26.SWISS-MODEL
工具链接：
https://swissmodel./

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27.Phyre2
工具链接：
http://www.sbg.bio./phyre2/html/page.cgi?id=index

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短序列拼接

28.Cap3
工具链接：
http://doua./software/cap3

image.png

GO富集分析

29.OmicShare GO富集分析工具
工具链接：
http://www./tools/home/report/goenrich.html

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KEGG富集分析

30.OmicShare KEGG富集分析工具
工具链接：
http://www./tools/home/report/koenrich.html

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趋势分析

31.OmicShare 趋势分析工具
工具链接：
http://www./tools/Home/Soft/trend

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蛋白结构域预测

32.Pfam
工具链接：
http://pfam./search

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33.SMART
工具链接：
http://smart./

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基因组杂合性评估

34.GenomeScope
工具链接：
http://qb./genomescope/analysis.php?code=example2

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圈图

35.CIRCOS
工具链接：
http://mkweb./tableviewer/visualize/

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36.热图
Omicshare 热图工具
工具链接：
http://www./tools/Home/Soft/heatmap

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注释工具

37.Omicshare 注释工具
工具链接：
https://www./tools/Home/Soft/getsoft/type/annotation

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细胞标记

38.CellMarker
工具链接：
http://biocc./CellMarker/index.jsp
circRNA数据库

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circRNA

39. circBase
工具链接：
http://www./

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40. CIRCpedia
工具链接：
http://www./rnomics/circpedia/

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small RNA

41. deepBase
工具链接：
http://rna./deepBase/

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42. sRNAanno
工具链接：
www.plantsRNAs.org

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lncRNA

43. TANRIC
工具链接：
http://bioinformatics./main/TANRIC:Overview

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44. NONCODE
工具链接：
http://www./

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ceRNA

45. starBase
工具链接：
http://rna./deepBase/

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46. miRSponge
工具链接：
http://bio-bigdata./miRSponge/

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序列翻译

47. ExPASy Translate tool
工具链接：
https://web./translate/

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48. ORFfinder
工具链接：
https://www.ncbi.nlm./orffinder/

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本文转载于微信公众号“生物信息学习”，仅用于学术分享！