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IPP秒杀Image J:一款高级的图像分析工具介绍

 永隆统 2020-05-12

校正图片的光密度

1.校正图片的光密度

2.新建一个新的校正参数

3.单击image后,出现弹窗后,鼠标单击图片空白处背景(一般数值应该在230左右),点击ok。

4.命名,然后点击system。

测量参数的设置

1.下图第3步,除了选中IOD,应同时选上area(左侧选上area,IOD即可),通过调节area的范围,分析时可以很好的剔除面积很小的点(一般IOD的范围不用改变)。

2.option 选项需要设置的有轮廓样式(根据图片选择),是否剔除边界的染色(一般选择none),以上设置好后,点击ok。

3.下图第5步选中后,直接鼠标点击染色部位(我一般从深到浅)至染色部分全部选中。按照步骤保存好方法后,点击close 然后直接点count。

1. 保存好设置好的方法后,接下来,按照前面的步骤,直接file→load file刚才保存的方法进行count就行了。

2.查看分析结果、导出结果。(点击view-statistics就能出现结果)

注:

(1)点击file后可出现数据结果导出路径;

(2)如果分析的组织是占满整个图片,直接看总的IOD值就行了。若不是,我们还应计算目标的面积,然后用IOD/area,这样得到的结果才更加的准确。

Tips

1. 拍摄时,光源亮度曝光时间应一致(不要使用自动曝光)。

2. 拍照前,应在空白背景处进行白平衡校正。(个人观点:拍照时尽量让照片整体亮一点,每次我显微镜的专业软件拍完照片后,觉得挺好的,但是放PPT上或分析时一看整体有点暗。)

3. 专业相机拍照时,应保存TIFF格式(TIFF是一种灵活的位图格式)。

image-Pro plus(IPP)是一种专业的图像分析软件

IPP能随意对图象切割、测量、计数、分类(材料学粒子粒径测量,生物学细胞或组织大小测量等);HE等染色方法的阳性灰度、阳性比例计算;简单电泳条带分析;荧光强度分析等。可以选择面积、周长、角度等50多种测量方式。

图像分析方面:

IPP能够荧光共位性分析;空间和灰度校对;将测量结果以统计值、单个测量值、三维浓度图和线形等方式输出,并可以将测量结果输出到EXCEL中处理。

而上文提到的免疫组化结果处理仅是其众多应用中的一种,希望大家可以充分的利用这个工具,更好地处理自己的科研结果。

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