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日常生活中所使用或食用的新鲜物质，在短暂的期间内即腐败、恶臭而不堪食用，包括暴露于空气中的物质或液体，均為大自然中有害或有益的微生物所左右。
而这些微生物在水草缸中扮演何种角色？有何影响？以下将為你介绍︰
何谓ＥＭ？
Effective micro-Organisms︰简称ＥＭ，就是有效益性的微生物群。微生物為人类肉眼不能观察的到之微小生物，统称為微生物，包括真核生物的藻类、原生动物、真菌、原核生物的细菌、蓝藻菌等。
细菌（微生物）存在于自然界，可利用于食品加工、堆肥、水质净化等。在自然界中筛选出具”安全性、有用性”的优良细菌，加以繁殖培养為有效益的微生物。
细菌概略可分為酵母菌、乳酸菌、光合成菌、固态氮菌、放射菌、丝状菌、枯叶杆菌、曲菌等，以上使用于水族界，其目的主要以分解水中有机物或抵销有害物质。
有机物在分解的过程中，以氧化过程（有氧状态）与发酵过程（无氧状态）两种模式进行，分别為嗜氧性微生物与厌氧性微生物在进行分解工作。当有机物在分解时產生恶臭的原因是因”有害的厌氧性菌”，在分解时產生阿摩尼亚或硫化氢等所引起的。
ＥＭ在水缸中的角色
在水族界中常听到的”硝化菌”一词，乃是狭义的指微生物各项功能中对于硝酸系列的硝化作用，而忽略了其它各项功能的微生物。将纤维素等化合中的水氧基，以硝酸机製换為硝酸酯，而硝化菌就是将阿摩尼亚经由亚硝酸，氧化為硝酸的回应称為硝化作用。
ＥＭ以生成抗氧化物质进行中繁殖，同时接连不断的分解有机物而不释出人们讨厌的臭气，将物废物分解且形成回归自然的有用元素。其功能与ＰＭ相反。
生物体所含物质（糖、蛋白质、脂肪........等）、残饵、残叶等在水中少部分由生物代谢外，大多数含有毒性的污染物（氨、亚硝酸、硫化氢等）仍倚赖有益的、有效的微生物予以分解利用转换為低毒性的硝酸盐，因此，ＥＭ可说是水族中的清道夫。
水族缸的水质恶化，大多归咎于投饵过多沉淀腐烂，或鱼只粪便未予吸出换水等，导致浮游生物、有害微生物（含病源体）异常繁殖，以致浮游水中的藻类光合作用及厌氧性细菌繁殖，进而演变成危害缸中鱼虾的氨、亚硝酸、硫化氢等浓度增加。当水质恶化时，不能倚赖药物控制抵销，因使用药物反而破坏水缸的生态平衡。
水缸中担任分解过滤的微生物，可分為两大类︰靠氧气生存的嗜氧性微生物，与不需氧气的厌氧性微生物。硝化菌属于嗜氧性的微生物，以利用氧气将对鱼虾有害的阿摩尼亚、亚硝酸予以氧化转换為无毒的硝酸盐。而将硝酸盐还原以氮气脱出的氮菌，即属于厌氧性微生物。嗜氧性与厌氧性微生物共同生存于过滤器的滤材内，担任著水缸中生态平衡的重要任务。
ＥＭ的功能
有益微生物除上述的功能外，还有其它的许多功能，以下将介绍水缸中常使用的微生物，并介绍其功能︰
酵母菌（Yeast bacteria）
1.促进有机物的溶化。
2.可将葡萄糖以一次代谢形成“丙酮酸”，丙酮酸是好氧性醋酸菌及厌氧性酪酸菌所需要的基质（微生物的食粮）。
3.二次代谢实行成贺尔蒙、维他命、核酸等生理活性物质，為提供并促进植物生长的成分。
乳酸菌（Lactic acid bacteria ）
1.增加光合成菌的作用，并做半腐态有机物的分解。
2.乳酸菌（属益菌类），可将鎌胞菌（Fusarium）杀灭。
3.消除水中恶臭气体。
4.促进有机物的发酵分解。
光合成菌
存在于自然界中的厌氧性有益微生物，能在光照下或缺氧中进行分解有毒物质。目前水族界较常利用的光合成菌以︰红色硫磺光合成菌、红色非硫磺光合成菌、绿色硫磺光合成菌為主。
高浓度的光合成菌液体呈现扑鼻的水沟臭味，约以一滴（１卅２３Ｃ.Ｃ）使用于１００公升水缸。业者出售时，以培养至去势阶段（消费者不能再予以繁殖），冲淡后装瓶出售。
其功能為︰
1.促进植物的光合成作用，强化水草本体对维他命Ｃ及Ｅ倍数的形成。
2.依生态连锁作用来安定ＰＨ值及溶氧量。
3.分解鱼只排泄物、死尸、残饵、腐叶所產生的有害物质，减低阿摩尼亚、亚硝酸、硫化酸、有机酸等。（光合成菌以吸收此為营养基质，并从NO2、NO3中夺取氧而释放氮，逸散于空气中。）
4.分解水中硫化氢后，可防止根丛腐烂。
5.抑制底砂中病源性有害细菌的繁殖。（与放射菌之功能相同）
6.可改善水质，使水质澄清、鱼只食慾旺盛、鱼只活泼体色鲜明、水草色泽鲜艳。
固态氮菌（氮固定菌）（azotobacter︰azotobacteria）
1.具氮固定作用，使植物易吸收，避免氮流失。
2.将空气中的氮气吸收而与脂肪酸合成。一呼吸作用放出“二氧化碳”，製造光合成菌的基质（微生物的食粮）与生存环境。光合成菌依此基质吸收太阳热能合成糖类，在无氧呼吸中產生氧气，作為氮固定的基质与生存环境。（氮固定菌呼吸作用產生“二氧化碳”，形成无氧状态供给无氧呼吸的光合成菌繁殖）
放射菌
分解有害物质成為有利植物光合作用的光合成菌，同时具有驱除有害病菌的抗菌作用，达成抑制腐败菌的繁殖。使水草叶壁节坚韧不易掉叶。
丝状菌
抑制病源性细菌，并促进有机物的可溶性。
枯叶杆菌
1.杆菌分泌“ 质”（如蛋白 ），分解磷酯连结之化合物，如核酸。分解水中有机质、氨、NO2。
2.另一种厌氧性杆菌在厌氧条件下（如旧水草缸底床），能產生维他命Ｂ12，供给水草及有益微生物利用。
曲菌
1.利用残饵中的碳水化合物為本身的养分，以降低水中污染物，防止霉菌繁殖。
2.能分泌各种的 质（如蛋白 ）。分解水中蛋白质、纤维素、胶质、脂质等。
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