在这决徙散流中，洪水淹没农田，冲毁平原上的城镇、村落。这一时期冲毁城镇有：郓城（1166年）、胙城（1186年）、杞县（1241年）、河阴（1356年）、仪封（1389年）、项城（1428年）、原武（1452年）、荥泽（1479年）等8个。
明代中期至清代中期，随着河道堤防的逐步完善，因水患迁城的城址出现自西北向东南发展的趋势。先后被洪水冲毁而迁移的城镇有：商丘(1505年)、城武、单县（1519年）、丰县（1526年）、虞城（1530年）、夏邑（1537年）、宿迁（1576年）、萧县（1577年）、砀山（1598年）、荥阳（1696年）、清河（1761年）、沛城（1781年）等12个。这一时期总共冲毁迁城的有20个。还有许多城镇虽未搬迁，但北宋的旧城今已压埋在黄土之下，成为地下城，如今开封城经黄河4次淹没，旧城已埋在4.5米深的地下。
北宋以后黄河南泛，造成的自然灾害，在客观上加速了中国经济重心从北方向南方的转移。
一、金代河患
金代黄河“数十年间或决或塞，迁徙无定。”这一时期自1128～1234年的106年中，有20年决溢（五年多一次）。
这一时期，黄河一度成为宋金、宋蒙的军事分界线，有4次人为决口，其灾情颇为惨烈。
1．金太宗天会六年（1128年）金兵南侵，十一月南宋东京留守杜充决开黄河堤御敌，黄河从此南泛入淮。为黄河第4次大改道。
决口处大致在卫州（治今汲县）和滑州（治今滑县东）之间。决水东流至梁山泊之南分为两支：南支入泗，北支入梁山泊（又名大野陂）而后入海。南支为主流，大致沿菏水故道入泗，泛水经“滑县南，濮阳、东明之间，再经鄄城、巨野、嘉祥一带汇入泗水，再由泗水人淮”。
2．金大定八年（1168年）六月河决李固渡，流经曹、单二州，较旧道偏南。次年勘视，新道过水6分，旧河过水4分。此后两河并行。
3．金大定二十年（1180年）秋河决卫州、延津及南支上的京东埽三处，决水漫衍至归德府（治今商丘县南），河水更南，南支是主流。
4．金明昌五年（1194年）八月“河决阳武故道，灌封丘而东”。
二、元代黄河决徙
元代黄河下游仍迁徙不定，决溢更加频繁，自至元五年（1268年）到至正二十六年（1366年）的99年中，史料中大水决溢年份达58年，也有一年决口十几处甚至几十处的，其中较大的决徙有：
1．蒙古太宗六年（1234年）六月，蒙兵决黄河寸金淀（黄河北岸延津境积水淀），灌开封宋兵，导致黄河又一次向南改道，河水南流至杞县三岔口分为三股，主流由涡河经亳州至海口入淮。三股分流约60余年。
2．大德元年（1297年）三月，黄河南决太康、扶沟、鹿邑，东决开封、陈留、杞、襄邑，下及归德、徐州、邳州和宿迁、睢宁二县。河道主流北徙。七月又决杞县蒲口，主流北移，北支成为主流，黄河由归德、徐州人泗、入淮，以至由济宁、鱼台等地人运河、入淮河。之后黄河连年决泛，如大德二年决蒲口等96处。直至明洪武后期（约1397年），河道又改向南趋颍、涡。近百年间，黄河水灾泛滥无宁岁，主要在北支，泛滥区在今豫东南、皖北、鲁西南。
3．大德九年（1305年）夏河决，洪水逼近开封，地方官打开祥符县董盆口，分水东流人巴河。主流遂由巴河东流。巴河又名白河。河道自阳武、封丘，经开封城东、陈留东北、兰阳（今兰考境）城南、仪封（今兰考东北30里）城南、杞县、睢州城、宁陵城北，更东即归德、徐州黄河的旧道。
4.1343～1349年黄河连年决口，洪水北侵安山入会通河夺大清河入渤海。至正十一年（1351年）贾鲁治水，挽河回复故道，自彭城入泗入淮。黄河流路自封丘西南，东经长垣南30里，东明（今东明集）南30里，转东南经曹县西之白茅、黄陵冈、商丘北30里再东经单县南，稍东南经夏邑北，再东经砀山南之韩家道口（砀山南约40里），再东经萧县北，徐州城北，下至邳州循泗入淮。
5．至正二十六年（1366年）黄河又北徙，“上自东明、曹、濮，下及济宁皆被其害”。水流人大清河。此后决溢，主流南趋。
三、明代河患
明代自1368一1643年的276年中，大水决溢的年份有124年，达45%。其中有9次较大。
1．洪武二十四年（1391年）四月河决原武黑洋山（在县北20里），主流东经开封城北五里，东南流由陈州人颍水，经项城、太和、颍州（今阜阳）东南至寿州正阳镇汇人于淮，时称大黄河。向东北一支由旧曹州、郓城两河口，漫东平之安山、会通河，称小黄河。
2．正统元年至十年（1436～1445年）黄河连续10年决溢，决口主要在开
封上下。
3．正统十三年（1448年）七月河决新乡八柳树。由故道东经延津、封丘，漫流山东曹州、濮州、范县，东抵阳谷县人运河，更从张秋南之沙湾决大洪口而东入海。主流北迁。另有荥泽孙家渡决口南漫至颍、涡水入淮，淹田数十万顷。
黄河北流冲毁漕运，自景泰三年至六年（1452～1455年）先后三次堵沙湾决口，随堵随决。自1448～1458年连年决泛。
4．弘治二年（1489年）五月庚申“河决开封黄沙岗、苏村野场至洛里堤之莲池、高门、冈王马头、红船湾六处。又决埽头五处入沁河。所经郡县多被害而注汴梁尤甚”。决水分三四支，南、东、北分流。
5．正德二年至五年（1507～1510年）、八年至十四年（1513～1519年）两次连年决泛。
正德二年（1507年）“黄河徙入泡河，大水坏民禾稼居舍”。三年“河又北徙三百里至徐州小浮桥”。四年六月又“北徙一百二十里至沛县飞云桥俱入运河”。五年“九月河自仪封北徙，冲黄陵冈，入贾鲁河，横流抵丰沛”。
正德八年（1513年）至十四年（1519年）黄河决黄陵冈，水淹曹、单、城武等县（详见附表1）。
6．嘉靖三十二年（1553年）河南、山东特大洪水，山西亦大水，其中伊、洛、汝、颍河为甚。“豫北人夏淫雨至七月不止，暴雨如注，河大决溢，民大饥，人死无算”。原阳“河决朱家庄，水至护城堤”。阳武“六月河溢，平地深丈余”。延津“六月暴雨如注，大水如河汉”。“豫西夏秋大水，伊、洛、汝、颍并溢，平地水深丈余，淹没田庐，人畜死者无算”。洛阳“六月大雨，伊、洛涨溢入城，水深丈余，漂没公廨民舍殆尽，人畜死者甚重”。偃师“夏六月大霖雨，伊、洛涨入城内，水深丈余，漂没民舍、公廨殆尽，人畜死者无数”。巩县“六月霖雨连旬，山水会聚，河洛泛涨，民居、官舍、公廨、官厅尽行冲空，荡然
无存，漂没人畜不可胜数”。
7．隆庆三年至万历五年（1569～1577年）黄河9年连续决泛，自归德至徐邳两州。运道淤浅，漕舟阻塞。归德府、淮安道南北千里漂没。
综上所述，明代自1391—1495年，黄河的决溢地点多在开封以上。自北岸筑太行堤以后，1496～1566年决溢地点下移兰阳、考城、曹县一带。
8．崇祯五年（1632年）山西、河南连降大雨，“秋壬寅陕州淫雨四十日，霉雨两昼夜，民房倾坏大半，黄河涨溢至上河头街，河神庙没”。六月河决盂津口．横浸数百里。
9．明末还有一次较大的人为决口，即崇祯十五年（1642年）九月李自成起义军围攻开封，久攻不克，官军扒开开封城北朱家寨河堤，欲水淹起义军，起义军决上游三十里之马家口，两股合流入城，溺死居民数十万，又说“死于饿者十之九”。
四、清代前期的黄河决徙（1644～1855年）
清初黄河归复晚明故道，顺治初年在开封、考城、兰阳、封丘、祥符等处决口，洪水多冲入运河。
康熙元年至十六年（1662～1677年）黄河下游几乎年年决溢，决口上起河南，下迄淮扬。其中康熙元年和十五年灾情为重：康熙元年五月“河决曹县石香炉、武陟大村、睢宁孟家湾。六月决开封黄练集，灌祥符、中牟、阳武、杞、通许、尉氏、扶沟七县。七月，再决归仁堤”。
十五年（1676年）夏久雨，黄河倒灌洪泽湖，高家堰大堤决口34处，淮水冲入淮阳运河，运河堤决口，大口两处宽300余丈。里下河7州县被淹，黄河又决口数十处，漕运阻塞。
雍正、乾隆两朝73年，黄河决溢26年。黄河下游各省均发生程度不同的决溢。其中河南决溢的年份占三分之一左右，上自武陟，下至考城各县均有决口；江南决溢的年份为三分之二上下，自砀山至阜宁各县均有决口，尤以铜山、睢宁两地决溢的次数最多。其间较大的决溢有4次：一是雍正元年（1723年）六月，黄河于中牟县十里店、娄家庄决口，洪水南人贾鲁河，“祥符、尉氏、扶沟、通许等县村庄田禾，淹没甚多”；七月黄河北岸又决武陟梁家营、二铺营土堤及詹家店、马营月堤；九月，再决郑州来童寨民堤，冲中牟县杨桥官堤。
二是乾隆七年（1742年）河决丰县石林、黄村，夺溜东趋，又决沛县缕堤。河南东部大水，西部、南部水，贾鲁、颍水决溢，山东、江苏淫雨，造成大面积洪涝，重者平地行舟，禾庐殆尽。
三是乾隆二十六年（1761年）七月，黄、沁河同时并涨，河南武陟、荥泽、阳武、祥符、兰阳南北两岸共决口15处。其中中牟杨桥决口达数百丈，大溜直趋贾鲁河，由涡河人于淮，河南开封、陈州、商丘及安徽之颍、泗等州被淹。
四是乾隆四十六年（1781年）五月，决睢宁魏家庄，大溜注入洪泽湖：七月决仪封，漫口20余处，北岸水势全由青龙冈夺溜北注，水人南阳、昭阳、微山等湖，余波人大清河。
嘉庆至道光两代计55年，黄河决溢24年，前期决口多在睢州以下，后期决溢地点逐渐上移。其间对河道影响大、灾害重的有二次大决泛：（一）嘉庆二十四年（1819年）七八月间陕西“大雨连绵，昼夜不息，四十余日，黄、渭、泾、洛各河同时涨发，渭河冲崩二百余村”。下游于七月“决祥符、陈留、中牟、兰阳、仪封，由涡入淮”。八月“决武陟北岸马营坝。大溜穿张秋人大清河，一股入卫河，正河筑坝断流”。（二）道光二十三年（1843年）黄河流域大水，六月黄沁并涨，决中牟下汛，下分3支由沙、涡等河入淮，淹皖北、豫东28州县。七月黄河中游发生特大洪峰：“七月十三日（农历）陕县万锦滩报长水七尺五寸。至十五日寅刻复长水一丈三尺三寸，计一日十时之间，长水二丈八寸之多，浪若排山，历考成案，未有长水如此猛骤者。”洪水过后，中牟决口刷至300余丈，河南中牟、尉氏、祥符、通许、陈留、淮宁、扶沟、西华、太康、杞县、鹿邑，安徽太和、阜阳、颍上、凤台、霍邱、亳州等地普遍遭受洪水泛滥之灾。今人实地调查后推算，在三门峡当年洪峰流量为36000立方米每秒，是近千年以来最大的洪水。
