前几日我们推出了质粒转化的基本操作问题,那么质粒的引物是怎样设计的呢?今天我们来唠一唠这个问题。 基因敲除通过降解具有同源序列靶基因的mRNA,达到阻止基因表达的作用。短发卡RNA (shRNA) 是可以克隆到表达载体并表达短的干扰RNA的DNA分子。我们可根据靶基因设计短发卡RNA (shRNA)序列并将其克隆到特定载体上。根据不同的载体,又可以进行常规质粒构建与慢病毒质粒构建。 克隆到ShRNA表达载体中的ShRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环序列分隔的,组成发夹结构,由polⅢ启动子控制,常用的茎环序列有5-CTCGAT-3;随后在连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。5-6个T必须放置在ShRNA插入片段尾部以确保RNA聚合酶III终止转录。 两个互补短反向重复序列两端须带有限制性酶切位点。 在正义链和反义链序列上不能出现连续3个或以上的T。这可能导致ShRNA转录的提前终止。 下面获得shRNA序列 CCGGGCTGGGATGATGGTAAGAGAACTCGAGTTCTCTTACCATCATCCCAGCTTTTTG 得到shRNA序列之后,下一步我们就要考虑选择质粒酶切位点啦,然后根据不同的连接方式处理shRNA,使之含有相应的酶切位点,进而与质粒载体相连接,下期为大家介绍~ |
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