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研究揭示了体内HIV-1感染细胞的多种特征

 zjshzq 2020-08-03

为了根治HIV-1感染,阐明HIV-1感染细胞在体内的详细特征和异质性非常重要。本研究采用造血干细胞移植的人源化小鼠模型,感染基因修饰的HIV-1,揭示了HIV-1生产细胞在体内的多种特征。

东京大学医学科学研究所(IMSUT)的研究小组利用HIV-1感染的细胞进行了 '多组学 '分析,这是最近开发的全面调查生物样本特征的技术。

我们的研究结果描述了体内HIV-1生产细胞的多种特征,这可以为HIV-1治疗方法的开发提供线索。'

东京大学医学科学研究所传染病防治系系统病毒学部研究首席科学家、副教授佐藤祺(Kei Sato)。

该研究成果于2020年7月14日发表在《细胞报告》上。

'HIV-1治愈 '的研究

为了根除HIV-1感染,深入了解体内HIV-1感染细胞的各种特征是非常重要的。

最近开发的 'omics '分析可以成为识别HIV-1感染细胞特征的有力工具。但是,需要注意的是,感染者体内的CD4+T细胞大部分是未被感染的,因此,体内 大量 CD4+T细胞的转录谱并不能反映HIV-1的感染细胞的特征。

通过多组学分析,全面揭示体内HIV-1感染细胞的特征。

在本研究中,研究小组使用了人类造血干细胞移植的人源化小鼠模型,在体内维持人类白细胞处于相对稳定的免疫条件下,并使用了四种最新开发的技术来研究病毒基因组学和转录组学。

据研究组介绍,本研究包括以下四项分析。

首先,液滴数字PCR揭示了感染的人源化小鼠体内存在潜在的病毒库。

第二,连接介导的PCR显示HIV-1更倾向于整合到开放的染色质区域,正如整合位点的表观遗传修饰与病毒产生的关联所示。

第三,数字RNA测序定量分析了HIV-1产生细胞中病毒转录物的绝对拷贝数,并进一步确定了病毒感染和未感染细胞之间差异表达的基因。最后,单细胞RNA测序揭示并表征了体内HIV-1产生细胞的异质性。

佐藤副教授强调:“据我们所知,这项研究是首次对HIV-1产生细胞进行多方面描述的研究,也是首次对HIV-1感染细胞在体内的特征进行全面研究”。

参考来源

Aso, H., et al. (2020) Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo. Cell Reports. doi.org/10.1016/j.celrep.2020.107887.


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