在TAIR 如何批量下载基因家族序列——TAIR拟南芥数据库使用指南（六）

                                                  这是一篇答疑帖

Q：可以在TAIR网站上直接下载基因家族序列吗？

下面是操作指南：

• 1、获取基因家族信息

  如果自己已经有整个基因家族的TAIR号是最好不过了，可以跳过这一步，直接进入下载的步骤；

  如果没有的话，就需要去查找该基因家族的成员和TAIR号信息；

  1）TAIR数据库提供了基因家族的信息，通过Browse中的Gene Families可以查看

    2）我们可以看到很多的基因家族

3）下面就以14-3-3家族为例，它成员比较少，可以直接点击进去获得Genomic Locus；

这一串就是下载需要用到的TAIR number了

4）如果是很多的基因的家族可以通过FTP直接下载基因家族信息

Note: TAIR基因家族的信息比较旧，建议查看最新的文献，查缺补漏。

5）利用bulk data retrieval工具批量下载基因家族序列

这个部分其实我在之前有介绍过

TAIR拟南芥数据库使用指南（一）

6）以基因组序列为例，选择Output Options 为FASTA，就可以获得14-3-3这个基因家族的所有成员的基因组序列了~

OK~整个流程并不难~关键的地方在于不要遗漏基因家族的成员~

希望这个答疑帖可以帮到咨询的朋友

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